Electronic Theses and Dissertation

IDENTIFIKASI PENYU HIJAU (Chelonia mydas) ASAL PULAU BANGKARU KABUPATEN ACEH SINGKIL BERDASARKAN
ANALISIS DNA MITOKONDRIA

ABSTRAK

Penyu hijau (Chelonia mydas) merupakan salah satu spesies penyu yang dilindungi dan memiliki distribusi luas di wilayah pesisir dunia, termasuk Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies dan asal-usul penyu hijau yang ditemukan di Pulau Bangkaru, Kabupaten Aceh Singkil, berdasarkan analisis DNA mitokondria. Pulau Bangkaru dikenal sebagai salah satu habitat penting bagi penyu hijau di Indonesia. Untuk mengetahui pola migrasi dan hubungan kekerabatan secara genetik penyu hijau di wilayah ini, dilakukan analisis terhadap sampel jaringan dari individu penyu hijau yang ditemukan di pulau tersebut. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah amplifikasi Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sekuensing gen DNA mitokondria, khususnya bagian gen sitokrom-b yang telah terbukti efektif dalam studi filogeografi spesies penyu. Hasil identifikasi spesies berdasarkan analisis Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) menunjukkan kelima sampel penyu hijau asal Pulau Bangkaru memiliki kemiripan dengan database Genbank, yaitu dengan persentase kemiripan sebesar 99,76% dan 100%. Analisis hubungan kekerabatan berdasarkan hasil konstruksi filogenetik menunjukkan penyu hijau asal Pulau Bangkaru berkerabat dekat dengan penyu hijau asal Jepang dan China. Hasil analisis menunjukkan bahwa penyu hijau yang berada di Pulau Bangkaru memiliki kecenderungan untuk berkelompok dalam sub-populasi tertentu, yang memiliki hubungan genetik dengan populasi penyu hijau di beberapa wilayah lain, termasuk pulau-pulau sekitar Samudra Hindia. Kesimpulan dari penelitian ini diharapkan dapat mendukung upaya konservasi penyu hijau dengan menyediakan data penting terkait keragaman genetik dan pola migrasi mereka, serta meningkatkan pemahaman tentang pentingnya pelestarian habitat bagi spesies ini.

Kata Kunci: Analisis DNA mitokondria, gen sitokrom-b, kekerabatan genetik, penyu hijau, Pulau Bangkaru.

IDENTIFICATION OF GREEN TURTLE (Chelonia mydas) FROM BANGKARU ISLAND, ACEH SINGKIL DISTRICT BASED ON MITOCHONDRIAL DNA ANALYSIS ABSTRAK Green turtle (Chelonia mydas) is one of the protected turtle species and has a wide distribution in coastal areas of the world, including Indonesia. This study aims to identify the species and origin of green turtles found on Bangkaru Island, Aceh Singkil Regency, based on mitochondrial DNA analysis. Bangkaru Island is known as one of the important habitats for green turtles in Indonesia. To determine the migration patterns and genetic relationships of green turtles in this area, an analysis of tissue samples from individual green turtles found on the island was conducted. The methods used in this study were Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification and mitochondrial DNA gene sequencing, especially the cytochrome-b gene section which has been proven effective in phylogeographic studies of turtle species. The results of species identification based on Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) analysis showed that the five green turtle samples from Bangkaru Island were similar to the Genbank database, with a similarity percentage of 99.76% and 100%. Analysis of kinship relationships based on phylogenetic construction results showed that green turtles from Bangkaru Island were closely related to green turtles from the Japan and China. The results of the analysis show that green turtles on Bangkaru Island tend to group in certain subpopulations, which have genetic relationships with green turtle populations in several other areas, including islands around the Indian Ocean. These findings are expected to support green turtle conservation efforts by providing important data on their genetic diversity and migration patterns, as well as increasing understanding of the importance of habitat conservation for this species. Keywords: Mitochondrial DNA analysis, cytochrome-b gene, genetic kinship, green turtle, Bangkaru Island.