ANALISIS DAN REKONSTRUKSI POHON FILOGENETIK BERDASARKAN GENOM NUKLEUS DAN KLO…
Zingiberaceae merupakan suku yang terbesar jumlahnya di antara delapan suku lainnya dalam ordo Zingiberales yang diperkirakan terdapat 52 marga dengan lebih dari 1500 jenis yang telah diidentifikasi. Suku Zingiberaceae banyak ditemukan tumbuh di hutan tropis, terutama di kawasan Malesiana (Indonesia, Malaysia, Brunei, Singapura, Filipina, dan Papua New Guinea. Hubungan kekerabatan antar jenis suku Zingiberaceae lebih mudah diinterpretasikan dengan menggunakan marka molekuler daripada karakter…
ANALISIS GEN 16S RRNA BAKTERI BERPOTENSI PROBIOTIK DARI IKAN KEMBUNG (RASTREL…
Telah dilakukan analisis gen 16S rRNA dari dua isolat bakteri LUI-02 dan LUI-04. Isolat ini merupakan bakteri berpotensi probiotik yang telah diisolasi dari lambung dan usus ikan kembung (Rastrelliger sp.). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jenis bakteri dari kedua isolat dengan melihat homologi sekuen nukleotida dengan mikroorganisme yang terdapat pada GenBank. Pertama, DNA genom bakteri diamplifikasi menggunakan instrumen PCR. Dua pasang primer yang digunakan adalah Bact-27F dan Uni…
ANALISA FILOGENETIK FAMILI DIPTEROCARPACEAE BERDASARKAN DNA BARCODING MATK
Analisa filogenetik famili Dipterocarpaceae berdasarkan dna barcoding matK bertujuan untuk menganalisa hubungan kekerabatan dari beberapa spesies famili Dipterocarpaceae dan membandingkan hasil analisa berdasarkan nilai bootstrap dan waktu yang dibutuhkan untuk membangun pohon filogenetik menggunakan algoritma Neighbor-joining, Maximum Parsimony dan Maximum Likelihood. Adapun tahapan analisa terdiri dari pengumpulan data, pengubahan struktur nama sekuen, penjajaran sekuen, konstruksi pohon, e…