Electronic Theses and Dissertation

Ikan kerapu memiliki permintaan pasar yang tinggi, namun ketersediaan data genetiknya masih terbatas. Kajian untuk memperoleh data molekuler dalam rangka mengoptimalkan potensi budidaya ikan kerapu adalah dengan mengkaji aspek genetiknya melalui DNA barcoding. Tujuan dalam penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies berdasarkan urutan barcode DNA dan status konservasi ikan kerapu Epinephelus spp. di perairan Kota Langsa. Penelitian ini dilakukan pada bulan Juni sampai Desember 2021 dan pengambilan sampel dilakukan di Kota Langsa, Provinsi Aceh. Sebanyak 22 sampel yang dikoleksi pada penelitian ini semua dapat diamplifikasi yang terdiri atas enam spesies ikan kerapu dari genus Epinephelus, yaitu Epinephelus coioides, Epinephelus bleekeri, Epinephelus malabaricus, Epinephelus erythrurus, Epinephelus poecilonotus, dan Epinephelus sexfasciatus. Jarak genetik antar spesies diketahui berkisar 0,10%-0,73% dengan rata-rata 0,40%. Hubungan kekerabatan yang paling dekat antara spesies Epinephelus malabaricus dengan Epinephelus coioides (4,07%). Status konservasi spesies Epinephelus coioides, Epinephelus malabaricus, Epinephelus erythrurus, Epinephelus poecilonotus dan Epinephelus sexfasciatus (94%) dikategorikan sebagai least concern/LC, sementara spesies Epinephelus bleekeri (6%) dianggap kurang data (data deficient/DD). Berdasarkan hasil penelitian ini pengelolaan perikanan berkelanjutan harus dilakukan untuk melindungi spesies dari potensi ancaman kepunahan.

The groupers is one of the most high market demand, but the availability of genetic data is still limited. The studies to obtain molecular data in order to optimize the potential of grouper aquaculture is to examine its genetic aspects through DNA barcoding. The objective of this study was to identify species based on DNA barcode sequences and the conservation status of grouper Epinephelus spp. in Langsa Citywaters. This study was conducted from June to December 2021, and samples were collected in Langsa City, Aceh Province. There were 22 samples that were collected in this study, and all samples that could be amplified consisted of six species of grouper from the genus Epinephelus, they were Epinephelus coioides, Epinephelus bleekeri, Epinephelus malabaricus, Epinephelus erythrurus, Epinephelus poecilonotus, and Epinephelus sexfasciatus. The genetic distance between species was from 0,10% to 0,73% with an average of 0,40%. Grouper relation of kinship the closest is between species Epinephelus malabaricus and Epinephelus coioides (4,07%). The conservation status of species Epinephelus coioides, Epinephelus malabaricus, Epinephelus erythrurus, Epinephelus poecilonotus and Epinephelus sexfasciatus(94%) was categorized as least concern/LC, while the species Epinephelus bleekeri (6%) was considered deficient data/DD. Based on the results of this study, sustainable fisheries management must be carried out to protect species from potential threats of extinction.