SUATU STUDI ANALISIS LC-MS/MS SECARA IN SILICO (MOLECULAR DOCKING) MAHLIGAI ULAN FUTRI Primary Author mixed material bibliography Banda Aceh Mipa-Farmasi 2022

Skripsi

ABSTRAK Coronavirus disease 2019 (COVID-19) adalah penyakit yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 yang menginfeksi saluran pernapasan. Salah satu tanaman yang diketahui memiliki aktivitas antivirus adalah Bawang putih (Allium sativum L.). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui senyawa-senyawa yang terkandung dalam ekstrak air bawang putih dan potensi senyawa bioaktif Bawang putih terhadap penghambatan protein dan enzim SARS-CoV-2 (protein Spike, PLpro, dan 3CLpro) dengan pendekatan molecular docking. Ekstrak air Bawang putih dianalisis mengunakan Liquid Chromatography- Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS) untuk diketahui senyawa aktif yang terkandung di dalamnya. Senyawa bioaktif dilakukan pengujian Lipinski Rule of Five (RO5), kemudian dilakukan penambatan menggunakan Autodock Vina dan hasilnya divisualisasikan menggunakan BIOVIA Discovery Visualizer 2020. Hasil analisis LC-MS/MS menunjukkan bahwa ekstrak air bawang putih mengandung enam senyawa yaitu Allicin, Allyl propenyl disulfide, Diallyl disulfide, Gamma-Glutamyl cysteine, Diallyl Trisulfide dan E-Ajoene. Hasil analisis molecular docking yaitu senyawa Gamma-Glutamyl cysteine memiliki binding affinity yang paling baik terhadap ketiga reseptor yaitu protein Spike, PLpro, dan 3CLpro dengan nilai berturut-turut sebesar -5,2, -5,4 dan -4,8 kkal/mol. Namun, nilai binding affinity senyawa aktif ekstrak air Bawang putih tidak ada yang melebihi dari kontrol positif yaitu nelfinavir. Nelfinavir pada reseptor protein Spike, PLpro, dan 3CLpro menunjukkan nilai binding affinity masing-masing secara berturut-turut sebesar -8,9, -7,0, dan -8,3 kkal/mol. Berdasarkan hasil analisis maka ekstrak air Bawang putih berpotensi terhadap penghambatan virus SARS-CoV-2, namun tidak lebih baik dari nelfinavir. Kata kunci : SARS-CoV-2, Allium sativum L., LC-MS/MS, molecular docking 0 ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION Universitas Syiah Kuala 97275 2022-01-14 11:46:19 2022-01-14 14:44:41 machine generated