AMPLIFIKASI GEN LIPASE DARI BAKTERI TERMOHALOFILIK ISOLAT PRIA LAOT SABANG (PLS) 76 | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    NULL

AMPLIFIKASI GEN LIPASE DARI BAKTERI TERMOHALOFILIK ISOLAT PRIA LAOT SABANG (PLS) 76


Pengarang

PODJA CHINTIA ANNISA - Personal Name;

Dosen Pembimbing



Nomor Pokok Mahasiswa

1708103010035

Fakultas & Prodi

Fakultas MIPA / Kimia (S1) / PDDIKTI : 47201

Subject
-
Kata Kunci
-
Penerbit

Banda Aceh : Universitas Syiah Kuala., 2021

Bahasa

Indonesia

No Classification

-

Literature Searching Service

Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)

ABSTRAK
Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan kekerabatan PLS 76 yang merupakan mikroorganisme termohalofilik - berdasarkan gen lipase dan mempelajari struktur lipase hasil translase gen secara bioinformatik. Amplifikasi secara PCR menggunakan sepasang primer Flip2-Rlip2 menghasilkan gen lipase berukuran 1300 bp, yang sesuai dengan ukuran gen lipase secara umum. Penjajaran urutan basa gen lipase pada NCBI menunjukkan bahwa PLS 76 memiliki homologi tertinggi (98%) dengan Geobacillus zalihae strain SURF-189 dan Geobacillus thermoleovorans strain ARTRW1. Analisis filogenetik dengan menggunakan 27 mikroorganisme dengan homologi >90% menunjukkan bahwa PLS 76 membentuk outgroup, mengindikasikan bahwa PLS 76 merupakan mikroorganisme yang berbeda. Lipase hasil translasi gen memiliki perbedaan 18 asam amino dengan tiga mikroorganisme pembanding. Enzim ini memiliki sisi pentapeptida Gly-Xaa-Ser-Xaa-Gly pada residu 194-198 dengan lubang oxyanion Leu-Thrp-Thr-His-Gly pada residu 60-65. Hasil ini mengindikasikan bahwa lipase PLS 76 termasuk kedalam lipase sub-famili 1.5. Pemodelan struktur menunjukkan bahwa lipase PLS 76 memiliki struktur monomer dengan dengan satu ion Ca2+.

Kata kunci: Lipase, PLS 76, sub-famili 1.5, structural modelling

Tidak Tersedia Deskripsi

Citation



    SERVICES DESK