Electronic Theses and Dissertation

Abstrak. Keberhasilan ekstraksi DNA sangatlah penting dalam proses investigasi genetika molekuler. Penggunaan sampel biasanya berupa organ tanaman muda karena diketahui dapat menghasilkan ekstrak DNA yang bagus. Kayu dan kulit kayu juga berpotensi sebagai sumber DNA karena sifatnya yang mudah didapat. Namun pengujian efektifitasnya untuk spesies Pinus merkusii belum pernah dilaporkan. Tujuan penelitian untuk membandingkan hasil ekstraksi DNA dari tiga jenis sampel dari spesies Pinus merkusii menggunakan tiga metode ekstraksi yaitu metode CTAB, CTAB dengan mercaptoethanol dan DNeasy Plant Mini Kit. Hasil ekstraksi dikuantifikasi menggunakan alat nanophotometer dan divisualisasi dalam gel agarosa. Dari ketiga metode ekstraksi DNA, metode CTAB memperoleh hasil kemurnian DNA yang lebih bagus baik pada uji kuantitas maupun uji kualitas . Semua metode memperoleh nilai optical density ratios di luar rentang kemurnian (?260/280 : 1,8 – 2,0 ng/µl dan ?260/230 : 2,0 ng/µl) pada sampel kayu, kulit kayu dan sampel daun khusus metode DNeasy Plant Mini Kit dan memperoleh nilai optical density ratios mencapai 1,8-2,0 ng/µl pada sampel daun dari metode CTAB dan metode CTAB dengan mercaptoethanol. Hasil ekstraksi DNA pada metode CTAB dan metode CTAB dengan menggunakan mercaptoethanol tidak menunjukkan hasil pita DNA yang dapat diinterpretasikan sama sekali, sedangkan pada metode DNeasy Plant Mini Kit menunjukkan pita DNA pada sampel KK3 dan D3 dan pada sampel lainnya juga tidak menunjukkan pita DNA yang dapat diinterpretasikan.
Kata Kunci: CTAB, Ekstraksi, DNA, DNeasy Plant Mini Kit

Tidak Tersedia Deskripsi