Electronic Theses and Dissertation

Tujuan dalam penelitian DNA Barcode ikan kerapu family Serranidae adalah untuk mengetahui spesies ikan kerapu dan kekerabatan jenis ikan kerapu di Aceh dengan menggunakan gen Cytochrome C Oxidase I (COI). Penelitian ini lakukan pada bulan Januari-Juli 2015 dan pengambilan sampel dilakukan di Aceh Timur, Banda Aceh, Aceh Besar, Aceh Jaya, Aceh Barat, dan Aceh singkil. Sebanyak 31 sampel yang dikoleksi pada penelitian ini, 31 sampel yang dapat diamplifikasi terdiri atas 9 spesies yang tergolong dalam 3 genus yaitu Cephalopholis, Epinephelus,dan Variola. Jarak genetik antar spesies bernilai 7,0%-24,4% dengan rata-rata 18,1%. Jarak genetik dalam spesies Epinephelus fasciatus yaitu 0,5% dan spesies Cephalopholis sonnerati yaitu 0,2%. Nilai jarak genetik antar genus berkisar antara 20,0%-22,6% dengan rata-rata 21,7%. Jarak genetik dalam genus Epinephelus berkisar 0%-13,9% dengan rata-rata 9,8%, Cephalopholis berkisar 0%-6,7% dengan rata-rata 4,3% dan Variola berkisar 0,2%-0,6% dengan rata-rata 0,3%. Hubungan kekerabatan ikan kerapu dilakukan dengan metode maximum likelihood yang membentuk tiga clade dan satu outgroup. Hubungan kekerabatan terjauh antara Variola albimarginata dengan Cephalopholis nigripinnis sedangkan hubungan kekerabatan yang dekat antara Cephalopholis nigripinnis dengan Cephalopholis sonnerati.

Kata kunci : DNA barcoding, Cytochrome C Oxidase I (COI), ikan kerapu

Tidak Tersedia Deskripsi