Electronic Theses and Dissertation

Kanker tiroid merupakan keganasan pada sistem endokrin yang terus meningkat dengan angka kejadian yang tinggi di Indonesia, hal ini menimbulkan beban biaya kesehatan yang besar. Perkembangan kanker ini dipengaruhi oleh ketidakseimbangan proses apoptosis yang dikendalikan oleh protein Bcl-2 serta proliferasi sel yang diregulasi oleh protein Ki-67. Upaya terapi kanker tiroid masih menghadapi keterbatasan dan efek samping, sehingga diperlukan alternatif dari bahan alami yang lebih aman. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawa bioaktif ekstrak gonad landak laut Diadema setosum sebagai inhibitor Bcl-2 dan Ki-67 melalui pendekatan in silico. Sebanyak 19 senyawa hasil analisis GC-MS dianalisis melalui molecular docking (PyRx 0.8) dan divisualisasikan dengan BIOVIA Discovery Studio 2021, kemudian diuji kestabilannya melalui molecular dynamic simulation (YASARA). Hasil menunjukkan bahwa cholesterylene dan cholesterin memiliki afinitas ikatan kuat, dengan cholesterin menunjukkan stabilitas terbaik berdasarkan analisis RMSD, RMSF, Rg, jumlah ikatan hidrogen, dan binding free energy. Dengan demikian, cholesterin diprediksi sebagai kandidat paling potensial untuk menghambat Bcl-2 maupun Ki-67, sehingga dapat dilakukan uji lebih lanjut dan berpeluang sebagai alternatif terapi kanker tiroid.

Thyroid cancer is an endocrine malignancy with a steadily increasing incidence in Indonesia, posing a significant healthcare burden. The progression of this cancer is influenced by an imbalance in apoptosis regulated by the Bcl-2 protein and cell proliferation regulated by the Ki-67 protein. Current therapeutic approaches for thyroid cancer still face limitations and side effects, thereby requiring alternative agents from natural sources that are safer. This study aimed to identify bioactive compounds from the sea urchin (Diadema setosum) gonad extract as inhibitors of Bcl-2 and Ki-67 through an in silico approach. A total of 19 compounds identified from GC-MS analysis were evaluated using molecular docking (PyRx 0.8) and visualized with BIOVIA Discovery Studio 2021, followed by molecular dynamic simulation (YASARA) to assess binding stability. The results showed that cholesterylene and cholesterin exhibited strong binding affinity, with cholesterin demonstrating the best stability based on RMSD, RMSF, Rg, hydrogen bond count, and binding free energy. Therefore, cholesterin is predicted to be the most potential candidate for inhibiting both Bcl-2 and Ki-67, making it feasible for further investigation and a promising alternative therapy for thyroid cancer.