DNA BARCODING TUMBUHAN KAYU PUTIH (MELALEUCA CAJUPUTI POWELL) ASAL ACEH, INDONESIA DAN TERENGGANU, MALAYSIA | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    SKRIPSI

DNA BARCODING TUMBUHAN KAYU PUTIH (MELALEUCA CAJUPUTI POWELL) ASAL ACEH, INDONESIA DAN TERENGGANU, MALAYSIA


Pengarang

PRITI RIZKI MONIKA - Personal Name;

Dosen Pembimbing

Essy Harnelly - 197501092000122002 - Dosen Pembimbing I
Saida Rasnovi - 197111131997022002 - Dosen Pembimbing II



Nomor Pokok Mahasiswa

2108104010078

Fakultas & Prodi

Fakultas MIPA / Biologi (S1) / PDDIKTI : 46201

Subject
-
Kata Kunci
-
Penerbit

Banda Aceh : Fakultas mipa., 2025

Bahasa

No Classification

-

Literature Searching Service

Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)

ABSTRAK


Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menentukan hubungan kekerabatan tumbuhan Kayu Putih (Melaleuca cajuputi Powell) dari wilayah Aceh dan Terengganu menggunakan metode DNA Barcoding berbasis gen rbcL. Sampel yang digunakan berasal dari empat lokasi di Aceh dan tiga lokasi di Terengganu. Ekstraksi DNA dilakukan menggunakan metode CTAB. Selanjutnya, dilakukan uji kemurnian, uji kualitas, serta amplifikasi DNA. Hasil amplifikasi dianalisis menggunakan sequencing Sanger, kemudian sekuensnya dicocokkan melalui database BLAST NCBI. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pita DNA berukuran 600-700 bp diperoleh dari semua sampel. Analisis BLAST mengindikasikan bahwa sampel-sampel tersebut memiliki kemiripan tinggi dengan spesies Melaleuca cajuputi. Konstruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa ketujuh sampel dari kedua wilayah membentuk sebuah clade yang mengelompok secara monofiletik dengan spesies Melaleuca cajuputi dan Melaleuca leucadendra. Penelitian ini membuktikan bahwa gen rbcL dapat digunakan sebagai marker molekuler untuk identifikasi tingkat genus, tetapi memiliki keterbatasan dalam membedakan hingga tingkat spesies.


Keywords : CTAB, DNA Barcoding, filogenetik, gen rbcL, Melaleuca cajuputi

ABSTRACT This study aims to identify and determine the phylogenetic relationships of the Cajuput (Melaleuca cajuputi Powell) from the regions of Aceh and Terengganu using DNA barcoding methods based on the rbcL gene. Samples were collected from four locations in Aceh and three locations in Terengganu. DNA extraction was carried out using the CTAB method, followed by DNA purity testing, quality assessment, and amplification. The amplification products were analyzed using Sanger sequencing, and the resulting sequences were compared using the NCBI BLAST database. The results showed that DNA bands of 600–700 bp were successfully obtained from all samples. BLAST analysis indicated that the samples had high similarity to Melaleuca cajuputi. Phylogenetic tree construction revealed that the seven samples from both regions formed a monophyletic clade clustering with Melaleuca cajuputi and Melaleuca leucadendra. This study demonstrates that the rbcL gene can be used as a molecular marker for identification at the genus level but has limitations in discriminating at the species level. Keywords : CTAB, DNA Barcoding, phylogenetics, rbcL gene, Melaleuca cajuputi

Citation



    SERVICES DESK