Electronic Theses and Dissertation

Ikan Famili Holocentridae merupakan salah satu kelompok ikan karang komersial yang umum ditemukan di perairan Aceh Besar, Indonesia. Tingginya kemiripan morfologi antarspesies dalam famili ini kerap menyebabkan kesulitan dalam proses identifikasi, sehingga diperlukan pendekatan taksonomi yang lebih akurat. Hingga saat ini, informasi taksonomi ikan Holocentridae di wilayah ini masih terbatas. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi ikan Famili Holocentridae secara morfometrik dan mengidentifikasi spesiesnya secara molekuler menggunakan pendekatan DNA barcoding. Penelitian dilaksanakan pada Agustus 2024 hingga Maret 2025. Sampel diperoleh dari enam lokasi pendaratan ikan yang ada di wilayah Kabupaten Aceh Besar dan Banda Aceh. Sebanyak 600 individu ikan (60 individu per spesies) dianalisis secara morfometrik dan lima individu dari masing-masing spesies dianalisis secara molekuler menggunakan gen Cytochrome c oxydase subunit 1 (COI). Data morfometrik dianalisis menggunakan ANOVA dan Discriminan Function Analysis (DFA). Hasil penelitian menunjukkan terdapat 10 spesies Holocentridae yang terdiri atas 5 spesies dari genus Myripristis dan 4 spesies dari Sargocentron. Karakter pembeda utama pada genus Myripristis adalah diameter badan (BD) jarak dari rahang atas ke pangkal awal sirip punggung (V), sedangkan pada Sargocentron meliputi panjang kepala (HL), panjang sirip perut (VFL), diameter badan (BD), dan bagian tubuh belakang (CPD, O, dan Q). Analisis DFA menunjukkan kedekatan morfometrik antara M. adusta, M. murdjan, dan M. violacea, serta antara S. rubrum dan S. praslin. Analisis DNA barcoding berhasil mengidentifikasi seluruh spesies dan memisahkannya ke dalam dua clade utama yaitu clade genus Myripristis dan clade genus Sargocentron. Hasil ini menunjukkan bahwa DNA barcoding mampu memperkuat dan mengonfirmasi identifikasi berbasis morfometrik. Integrasi antara kedua data tersebut meningkatkan akurasi identifikasi spesies Holocentridae. Penelitian ini memberikan kontribusi penting dalam penyediaan data morfometrik dan genetik untuk mendukung pengelolaan ikan Holocentridae di perairan Aceh Besar, Indonesia.

Fish of the Holocentridae family are one of the most common commercial reef fish groups found in the waters of Aceh Besar, Indonesia. The high morphological similarity between species in this family often causes difficulties in the identification process, necessitating a more accurate taxonomic approach. Currently, taxonomic information on Holocentridae fish in this region remains limited. Therefore, this study aims to characterize Holocentridae fish morphometrically and identify their species molecularly using DNA barcoding. The research was conducted from August 2024 to March 2025. Samples were collected from six fish landing sites in Aceh Besar and Banda Aceh districts. A total of 600 fish individuals (60 individuals per species) were analyzed morphometrically, and five individuals from each species were analyzed molecularly using the Cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) gene. Morphometric data were analyzed using ANOVA and Discriminant Function Analysis (DFA). The study results showed 10 Holocentridae species, consisting of 5 species from the genus Myripristis and 4 from Sargocentron. The main distinguishing characteristics in the genus Myripristis are body diameter (BD) and the distance from the upper jaw to the base of the dorsal fin (V). At the same time, the Sargocentron includes head length (HL), ventral fin length (VFL), body diameter (BD), and posterior body parts (CPD, O, and Q). DFA analysis showed morphological closeness between M. adusta, M. murdjan, and M. violacea, and between S. rubrum and S. praslin. DNA barcoding analysis successfully identified all species and separated them into two main clades: the Myripristis and the Sargocentron. These results indicate that DNA barcoding can reinforce and confirm morphometric-based identification. Integrating both datasets improves the accuracy of Holocentridae species identification. This study provides essential contributions by supplying morphometric and genetic data to support Holocentridae fish management in Aceh Besar, Indonesia.