Electronic Theses and Dissertation
Universitas Syiah Kuala
NULL
ANALISA FILOGENETIK SUKU DIPTEROCARPACEAE BERDASARKAN GEN KLOROPLAS MATK MENGGUNAKAN ALGORITMA BAYESIAN INFERENCE
Pengarang
Mirna Yunita - Personal Name;
Dosen Pembimbing
Nomor Pokok Mahasiswa
1108107010065
Fakultas & Prodi
Fakultas MIPA / Informatika (S1) / PDDIKTI : 55201
Subject
Kata Kunci
Penerbit
Banda Aceh : Universitas Syiah Kuala., 2015
Bahasa
Indonesia
No Classification
-
Literature Searching Service
Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)
Suku Dipterocarpaceae memiliki jenis yang cukup banyak dan masing-masing dari jenis tersebut mempunyai kemiripan morfologi yang sangat mirip. Hal ini mengakibatkan adanya kesulitan pengelompokan jika hanya dilihat berdasarkan morfologi. Oleh karena itu, penelitian ini akan melakukan analisa filogenetik berdasarkan gen kloroplas matK. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa hubungan kekerabatan dari beberapa jenis suku Dipterocarpaceae menggunakan algoritma Bayesian Inference dan membandingkan hasil analisa berupa pohon filogenetik menggunakan algoritma Bayesian Inference, Neighbour-joining, Maximum likelihood dan Maximum parsimony. Tahapan analisa yang dilakukan terdiri dari pengumpulan data, perubahan struktur nama sekuen, penjajaran sekuen, konstruksi pohon menggunakan metode MCMC, evaluasi dan analisa pohon filogenetik. Hasil analisa menunjukkan bahwa marga Dipterocarpus tidak membentuk monophyletic group dengan marga lain dari puak Dipterocarpeae. Hasil perbandingan menggunakan tiga algoritma lain (Neighbour-joining, Maximum likelihood dan Maximum parsimony) menunjukkan bahwa algoritma Bayesian memiliki waktu konstruksi pohon paling lama diantara algoritma lainnya.
Kata Kunci : Dipterocarpaceae, Filogenetik, bayesian inference, mcmc
Tidak Tersedia Deskripsi
ANALISA FILOGENETIK FAMILI DIPTEROCARPACEAE BERDASARKAN DNA BARCODING MATK (Ulfi Maulida, 2014)
ANALISIS DAN REKONSTRUKSI POHON FILOGENETIK BERDASARKAN GENOM NUKLEUS DAN KLOROPLAS PADA SUKU ZINGIBERACEAE (Haya Maghfira, 2022)
ANALISIS DAN REKONSTRUKSI POHON FILOGENETIK BERDASARKAN GENOM NUKLEUS DAN KLOROPLAS PADA FAMILIA DIPTEROCARPACEAE (Audina Yoeliarniza, 2017)
DNA BARCODING MENGGUNAKAN PENANDA KLOROPLAS PADA SUKU DIPTEROCARPACEAE DI DESA KETAMBE, ACEH TENGGARA (Nita Tauhida, 2022)
PERANCANGAN APLIKASI KUNCI IDENTIFIKASI MOLEKULER TRIBE SHOREAE (DIPTEROCARPACEAE) BERDASARKAN CPDNA MATK (Aisyah Humaira, 2018)