Electronic Theses and Dissertation

Setiap daerah atau suku bangsa memiliki ciri khas masing-masing dalam hal pengobatan tradisonal yang disebabkan oleh kondisi alamnya, terkhusus ketersedian tumbuhan yang berkhasiat obat di masing-masing daerah. Taman Nasional Gunung leuser salah satu taman terbesar di Indonesia yang melindungi 158 spesies tumbuhan obat. Famili Fabaceae dan Rutaceae merupakan dua kelompok tumbuhan dengan potensi besar sebagai sumber obat herbal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa dari famili tumbuhan yaitu Fabaceae (spesies Dalbergia parviflora dan Flemingia strobilifera) serta famili Rutaceae (spesies Citrus aurantifolia, Citrus hystrix dan Ruta graveolens) yang berpotensi sebagai kandidat obat untuk HIV (human immunodeficiency virus), hepatitis, TBC (tuberculosis), kanker payudara dan kanker kulit. Senyawa-senyawa tersebut dipreparasi dan diuji menggunakan metode in silico, termasuk pengujian Lipinski’s Rule of Five dengan SWISSADME dan molecular docking dengan PyRx. Struktur 3D protein target diunduh dari Protein Data Bank dan diproses menggunakan BIOVIA Discovery Visualizer 2021. Hasil docking dianalisis berdasarkan nilai binding affinity dan interaksi ligan-reseptor divisualisasikan untuk menentukan senyawa dengan aktivitas terbaik. Rutagravine dari famili Rutaceae spesies Ruta graveolens memiliki nilai binding affinity paling baik untuk daya hambat TBC yaitu -9,2 kkal/mol dan memiliki 2 ikatan hidrogen. Ammajin dari famili Rutaceae spesies Ruta graveolens memiliki nilai binding affinity paling baik untuk daya hambat HIV yaitu -10,2 kkal/mol dengan 4 ikatan hidrogen yang terjadi. Helioxanthin dari famili Rutaceae spesies Ruta graveolens memiliki nilai binding affinity paling baik untuk daya hambat Hepatitis yaitu -8,4 kkal/mol dan memiliki 1 ikatan hidrogen. (-)-Ribalinine dari famili Rutaceae spesies Ruta graveolens memiliki nilai binding affinity paling baik untuk daya hambat kanker payudara yaitu -8,8 kkal/mol dan memiliki 2 ikatan hidrogen. Serta Quercetin dari famili Rutaceae spesies Citrus aurantifolia memiliki nilai binding affinity paling baik untuk daya hambat kanker kulit yaitu -8,5 kkal/mol dan memiliki 3 ikatan hidrogen.

Each region or ethnic group has distinctive characteristics in traditional medicine, largely influenced by the natural conditions and the availability of medicinal plants in their respective areas. Gunung Leuser National Park, one of the largest parks in Indonesia, protects 158 species of medicinal plants. The Fabaceae and Rutaceae families are two groups of plants with significant potential as sources of herbal medicine. This study aims to identify compounds from the Fabaceae family (Dalbergia parviflora and Flemingia strobilifera species) and the Rutaceae family (Citrus aurantifolia, Citrus hystrix, and Ruta graveolens species) that have potential as drug candidates for TB, HIV, Hepatitis, breast cancer, and skin cancer. The compounds were prepared and tested using in silico methods, including Lipinski’s Rule of Five analysis with SWISSADME and molecular docking with PyRx. The 3D structures of target proteins were downloaded from the Protein Data Bank and processed using BIOVIA Discovery Visualizer 2021. Docking results were analyzed based on binding affinity values, and ligand-receptor interactions were visualized to identify compounds with the best activity. Rutagravine from the Rutaceae family of Ruta graveolens species has the best binding affinity value for TB inhibition of -9.2 kcal/mol and has 2 hydrogen bonds. Ammajin from the Rutaceae family, Ruta graveolens species, has the best binding affinity value for HIV inhibition, namely -10.2 kcal/mol with 4 hydrogen bonds occurring. Helioxanthin from Rutaceae family Ruta graveolens species has the best binding affinity value for Hepatitis inhibition which is -8.4 kcal/mol and has 1 hydrogen bond. (-)-Ribalinine from the Rutaceae family Ruta graveolens species has the best binding affinity value for breast cancer inhibition which is -8.8 kcal/mol and has 2 hydrogen bonds. And Quercetin from the Rutaceae family of Citrus aurantifolia species has the best binding affinity value for skin cancer inhibition, which is -8.5 kcal/mol and has 3 hydrogen bonds.