Electronic Theses and Dissertation

ABSTRAK

Bakteri Asam Laktat (BAL) merupakan golongan bakteri Gram positif yang berbentuk kokus atau batang, tidak berspora serta dapat memproduksi asam laktat sebagai produk utama dari metabolisme karbohidrat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik fisiologis BAL asal saluran pencernaan tiram pasifik (Crassostrea gigas), menentukan nilai Minimum Inhibitory Concentration (MIC) dalam menghambat pertumbuhan bakteri, dan mengidentifikasi secara molekuler menggunakan gen 16S rRNA. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode deskriptif dan eksperimental. Parameter yang diamati adalah karakter secara fenotipik (biokimia), nilai Minimum Inhibitory Concentration (MIC) dari isolat TB3C1 dan TN3C1, dan posisi gen 16S rRNA isolat TN3C1 dalam pohon filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa berdasarkan karakterisasi biokimia diduga terdapat tiga isolat dari genus Streptococcus (TB2C1, TB3C1 dan TN1C3), dua isolat dari genus Enterococcus (TB2C2 dan TN3C1), dan satu isolat dari genus Vagococcus (TN1C2). Nilai Minimum Inhibitory Concentration (MIC) menunjukkan isolat TN3C1 mampu menghambat pertumbuhan bakteri S. aureus dengan konsentrasi yang rendah (1,56%), sedangkan isolat TB3C1 mampu menghambat pertumbuhan bakteri B. subtilis dengan konsentrasi yang lebih besar (25%). Berdasarkan identifikasi molekuler menggunakan gen 16S rRNA, isolat TN3C1 berada dalam satu grup dengan Enterococcus faecium strain CAU5702 dengan nilai bootstrap sebesar 100%.

Kata kunci: Bakteri Asam Laktat (BAL), tiram Pasifik, Minimum Inhibitory Concentration (MIC), gen 16S rRNA

ABSTRACT Lactic Acid Bacteria (LAB) is a group of Gram-positive bacteria that are cocci or rod-shaped, non-sporing and can produce lactic acid as the main product of carbohydrate metabolism. This study aims to determine the physiological characteristics of LAB from the digestive tract of pacific oysters (Crassostrea gigas), to determine the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) value in inhibiting bacterial growth and to identify molecularly using the 16S rRNA gene. The methods used in this research are descriptive and experimental methods. The parameters observed were phenotypic physiological character, Minimum Inhibitory Concentration (MIC) value between TB3C1 and TN3C1 and 16S rRNA gene position of TN3C1 isolate in phylogenetic tree. The results showed that physiological characterization suspected three isolates of the genus Streptococcus (TB2C1, TB3C1 and TN1C3), two isolates of the genus Enterococcus (TB2C2 and TN3C1), and one isolate of the genus Vagococcus (TN1C2). The Minimum Inhibitory Concentration (MIC) value shows that TN3C1 isolate was able to inhibit the growth of S. aureus bacteria with a low concentration (1.56%), while TB3C1 isolate was able to inhibit the growth of B. subtilis bacteria with a greater concentration (25%). Based on molecular identification using the 16S rRNA gene, isolate TN3C1 is in a group with Enterococcus faecium strain CAU5702 with a bootstrap 100%. Keywords: Lactic Acid Bacteria (LAB), Pacific oyster, Minimum Inhibitory Concentration (MIC), 16S rRNA gene