Vannisa Fadya Primary Author mixed material bibliography Banda Aceh Fakultas Kedokteran

Skripsi

Proses penyembuhan luka melibatkan serangkaian mekanime seluler dan molekuler. Glycogen synthase kinase-3β (GSK-3β) dan kolagenase adalah enzim yang berperan dalam regulasi proses penyembuhan luka. Kadar kedua enzim ini mengalami peningkatan pada luka kronis yang mengalami fase inflamasi lebih panjang, seperti luka pada diabetes mellitus tipe 2. GSK-3β penting dalam menstimulasi proliferasi fibroblas, sedangkan kolagen adalah salah satu matriks ekstraseluler yang berperan sebagai pendukung struktural dan menghubungan jaringan dalam tubuh. Degradasi kolagen dimediasi oleh matriks metaloproteinase (MMP) yang disebut kolagenase. Minyak nilam yang dihasilkan oleh tanaman nilam memiliki senyawa kimia aktif dengan potensi anti-inflamasi dan anti-oksidan yang diharapkan berperan dalam mempercepat proses penyembuhan luka. Penelitian ini bertujuan untuk menemukan senyawa-senyawa aktif dalam minyak nilam Aceh yang berperan dalam proses penyembuhan luka kronis dengan menghambat enzim GSK-3β dan kolagenase melalui pendekatan bioinformatika, yaitu molecular docking dan molecular dynamic simulation. Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan 14 senyawa kimia aktif minyak nilam aceh yang diperoleh dari hasil gas chromatography-mass spectrophotometry (GC-MS). Sediaan ligan senyawa aktif diambil dari Pubchem dan target protein diunduh dari Protein Data Bank. Pendekatan ini terdiri dari molecular docking menggunakan PyRx 8.0. Molecular dynamic simulation dilakukan pada satu senyawa aktif paling potensial menggunakan YASARA untuk menilai stabilitas kompleks ligan-protein. Hasil dari molecular docking menunjukkan 7 senyawa kimia aktif pada kompleks ligan-GSK-3β dan satu senyawa kimia aktif pada kompleks ligan-kolagenase dengan nilai binding affinity di bawah -7 kkal/mol. Tujuh senyawa tersebut adalah napthalenone, (-) spathulenol, globulol, (-)- globulol, patchouli alkohol, δ-guaiene, dan caryophyllene. Senyawa kimia potensial terbaik terhadap kedua enzim tersebut adalah napthalenone. Selanjutnya, hasil molecular dynamic simulation menunjukkan napthalenone memiliki stabilitas yang baik melalui parameter jumlah ikatan hydrogen, radius of gyration, dan root mean square fluctuation. Dapat disimpulkan bahwa napthalenone adalah senyawa kimia aktif paling potensial untuk aktivasi penyembuhan luka kronis melalui penghambatan enzim GSK-3β dan kolagenase berdasarkan nilai binding affinity pada molecular docking dan kestabilan kompleksnya pada molecular dynamic simulation. Kata kunci: GSK-3β, Kolagenase, Minyak nilam, Penyembuhan luka kronis 0 ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION Universitas Syiah Kuala 118009 2023-12-15 13:16:06 2023-12-18 09:47:02 machine generated