Electronic Theses and Dissertation

Ikan famili Carangidae merupakan ikan pelagis dengan nilai ekonomis di perairan Aceh. Data statistik KKP menunjukkan hasil tangkapan ikan famili Carangidae meningkat dari tahun ke tahun sehingga pada tahun 2020 hasil tangkapan mencapai 106.569 kg. Salah satu upaya untuk mengidentifikasi dan mengelola keanekaragaman hayati adalah dengan mengumpulkan data genetik. Namun, penelitian mengenai data genetik ikan famili Carangidae masih sangat terbatas khususnya di perairan utara Aceh. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies ikan famili Carangidae di perairan utara Aceh secara molekuler menggunakan Cytochrome Oxydase Subunit I (COI) mtDNA dengan teknologi DNA Barcoding. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret sampai Juni 2023. Pengambilan sampel dilakukan di PPS Kutaradja Lampulo, Kota Banda Aceh. Metode ekstraksi DNA dilakukan dengan menggunakan metode 2X Buffer C-TAB. Total sekuen yang dihasilkan pada penelitian ini berjumlah 24 sekuen dengan panjang 635 base pairs (bp). Sebanyak 8 spesies ikan famili Carangidae berhasil diidentifikasi yakni Carangoides coeruleopinnatus, Carangoides hedlandensis, Carangoides malabaricus, Carangoides telamparoides, Caranx ignobilis, Caranx melampygus, Caranx sexfasciatus, dan Scyris indica. Rata-rata jarak berdasarkan kimura-2-parameter adalah 0,0037. Analisis jarak genetik dan pohon filogentik menunjukkan jarak genetik paling dekat dengan nilai 3,13% terdapat pada Carangoides malabaricus dan Carangoides talamparoides, sedangkan jarak terjauh dengan nilai 21,46% terdapat pada Caranx ignobilis dan Carangoides talamparoides. Tujuh spesies masuk kedalam kategori Least Concern (LC) dan satu spesies yakni Carangoides talamparoides masuk kedalam kategori Not Evaluated dengan penurunan tren populasi pada spesies Caranx sexfasciatus. Hasil penelitian dapat menjadi informasi mendasar bagi pengelolaan sumber daya ikan famili Carangidae di perairan Utara Aceh.

Carangidae fish are pelagic fish that have a high economic value in Aceh waters. According to KKP statistics, the catch of fish from the Carangidae family continues to rise year after year, reaching 106,569 kg in 2020. The collection of genetic data is one of the efforts to identify and manage biodiversity. However, research on the genetic data of Carangidae family fish is still very limited, particularly in northern part of Aceh waters. The goal of this study was to use Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) mtDNA with DNA Barcoding technology to molecularly identify Carangidae fish species in northern part of Aceh waters. This study was carried out between March and June of 2023. The sampling took place at PPS Kutaradja Lampulo in Banda Aceh City. The DNA extraction method used was the 2X Buffer C-TAB method. The total number of sequences produced in this study was 24, with a total length of 635 base pairs (bp). Carangoides coeruleopinnatus, Carangoides hedlandensis, Carangoides malabaricus, Carangoides telamparoides, Caranx ignobilis, Carangoides melampygus, Carangoides sexfasciatus, and Scyris indica were all identified. Within species, the mean genetic distance based on kimura-2 parameters was 0.0037. The closest genetic distance, with a value of 3,13%, was found in Carangoides malabaricus and Carangoides talamparoides, while the furthest distance, with a value of 21,46%, was found in Caranx ignobilis and Carangoides talamparoides. Seven species are classified as Least Concern (LC), and one species, Carangoides talamparoides, is classified as Not Evaluated; Caranx sexfasciatus has a declining population trend. The findings of the study can be used to help manage fish resources in the Carangidae family in northern part of Aceh waters.