Electronic Theses and Dissertation

Tanaman nilam merupakan penghasil minyak atsiri yang berperan penting dalam meningkatkan devisa negara atau peningkatan Produk Domestik Regional Bruto (PDRB) bagi negara yang digunakan dalam dunia industri. Tanaman nilam yang ada di Indonesia terdiri dari tiga jenis nilam yaitu Pogostemon cablin (Blanco) Benth. (nilam aceh), Pogostemon hortensis Backer., (nilam sabun) dan Pogostemon heyneanus Benth. (nilam jawa). Tanaman nilam aceh (Pogostemon cablin (Blanco) Benth.) merupakan jenis tanaman nilam yang pertama kali dibudidayakan secara luas hampir di seluruh wilayah Aceh, dan memiliki beberapa varietas, diantaranya adalah varietas sidikalang, varietas tapaktuan, varietas lhokseumawe, varietas patchoulina 1 dan varietas patchoulina 2. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kekerabatan kelima varietas tersebut karena belum diketahui dan belum ada publikasi yang membahas mengenai kekerabatan kelima varietas nilam aceh dengan pendekatan molekuler menggunakan gen ITS. Metode penelitian yang digunakan adalah deskriptif yang meliputi beberapa tahapan, yaitu tahap ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB, amplifikasi DNA menggunakan gen ITS, sequencing, penyejajaran data hasil sequencing, dan perekonstruksian pohon filogenetik menggunakan MEGA X dengan metode Maximum Parsimony menggunakan bootstrap sebanyak 1000 pengulangan. Hasil amplifikasi dari 15 sampel berdasarkan gen ITS pada penelitian ini menghasilkan pita DNA yang berkisar 650-700 bp. Hasil dari penyejajaran selanjutnya dibandingkan dengan data pada GenBank. Hasil dari rekonstruksi pohon filogenetik berdasarkan gen ITS diperoleh 2 kelompok membentuk monofiletik dan polifiletik. Kelompok pertama SD (2), SD (1), TP (1), TP (2), TP (3), LH (1), LH (2), LH (3), P 1 (1), P 2 (1), P 2(3) membentuk monofiletik yang mana kelompok anggotanya berasal dari satu nenek moyang yang sama dan kelompok kedua P 1(2), P 1 (3), P 2 (2) memiliki karakter DNA yang berbeda dari kelompok sidikalang, lhokseumawe dan tapak tuan, sehingga kelompok ini membentuk grup polifiletik.

Kata kunci: Filogenetik, Gen ITS, Pogostemon cablin.

Patchouli plants are a class of essential oils that play an important role in increasing foreign exchange or increasing Gross Regional Domestic Product (GRDP) for countries used in the industrial world. Patchouli plants in Indonesia consist of three types of patchouli, namely Pogostemon cablin (Blanco) Benth. (patchouli aceh), Pogostemon hortensis Backer., (soap patchouli) and Pogostemon heyneanus Benth. (Java patchouli). Patchouli aceh (Pogostemon cablin (Blanco) Benth.) is the first type of patchouli plant to be widely cultivated in almost all regions of aceh, and has several varieties, including the sidikalang variety, tapaktuan variety, lhokseumawe variety, patchoulina 1 variety and patchoulina 2 variety. This study aims to determine the kinship of the five varieties because it is not yet known and there are no publications that discuss the kinship of the five varieties of aceh patchouli with a molecular approach using the ITS gene. The research method used is descriptive which includes several stages, namely the DNA extraction stage using the CTAB method, DNA amplification using the ITS gene, sequencing, alignment of sequencing data, and phylogenetic tree construction using MEGA X with the Maximum Parsimony method using a bootstrap of 1000 repetitions. The amplification results of 15 samples based on the ITS gene in this study produced DNA bands ranging from 650-700 bp. The results of the alignment were then compared with the data in GenBank. The results of the phylogenetic tree reconstruction based on the ITS gene obtained 2 groups forming monophyletic and polyphyletic. The first group SD (2), SD (1), TP (1), TP (2), TP (3), LH (1), LH (2), LH (3), P 1 (1), P 2 (1), P 2 (3) formed monophyletic in which the group members came from the same ancestor and the second group P 1 (2), P 1 (3), P 2 (2) have different DNA characters from the sidikalang, lhokseumawe and tapak tuan groups, so this group forms a polyphyletic group. Keyword: Phylogeneti, ITS gene, Pogostemon cablin.