ELLENIA RAKASHIWI Primary Author mixed material bibliography Banda Aceh Fakultas mipa 2023

Skripsi

Identifikasi mikroorganisme ekstremofilik dari sumber air panas bawah laut di Pria Laot Sabang Aceh (PLS) 76 dilakukan untuk mengetahui apakah PLS 76 merupakan spesies baru. Hubungan kekerabatan PLS 76 dianalisis secara genotipik melalui analisis urutan gen 16S rRNA menggunakan sepasang primer Bact 27F-Uni 1492R dan data Whole Genome Sequencing (WGS), serta secara kemotaksonomi berdasarkan komposisi lipid membran dan persentase GC. Berdasarkan hasil analisis filogenetik menggunakan gen 16S rRNA PLS 76 menunjukkan cabang terpisah dan kekerabatan terdekat dengan Geobacillus zalihae T1, sementara hasil WGS menyatakan bahwa PLS 76 mirip dengan G. kaustophilus NRBC 102445. Namun komposisi lipid membran PLS 76 yang ditentukan dengan GC-MS dan persentase GC (guanin-sitosin) menunjukkan perbedaan dari bakteri termofilik lain. Sehingga disimpulkan bahwa PLS 76 merupakan bakteri Geobacillus kaustophilus strain baru khas Pria Laot Sabang. Karakterisasi gen penghasil antibiotik dilakukan untuk mengetahui kemampuan PLS 76 dalam memproduksi senyawa antibiotik. Data WGS dimanfaatkan untuk melihat gen tunggal dan kelompok gen penghasil antibiotik menggunakan program antiSMASH 6.1.1. Terdapat dua gen tunggal pengkode antibiotik antitoxin EndoAI dan gallidermin. Hasil identifikasi kelompok gen dengan antiSMASH 6.1.1 menunjukkan adanya dua region yang mirip dengan gen penghasil geobacillin I (region I) dan fengycin (region IV). Sehingga disimpulkan bahwa PLS 76 dapat mengekspresikan antibiotik pada kondisi yang sesuai. 0 ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION Universitas Syiah Kuala 107891 2023-01-03 12:29:42 2023-01-03 14:49:41 machine generated