Electronic Theses and Dissertation

Ikan Tongkol abu-abu (Thunnus tonggol) merupakan salah satu spesies ikan pelagis yang memiliki sifat oseanodromous yang sepenuhnya hidup dan beruaya di laut. Populasi Thunnus tonggol hidup di perairan yang jernih dan berada pada zona neritik. Penelitian spesies ini belum banyak dilakukan di Perairan Indonesia terutama Perairan Aceh sehingga diperlukan kajian identifikasi morfologi dan keragaman genetik. Tujuan penelitian ini yaitu menganalisis keragamanan genetik populasi Thunnus tonggol dari beberapa perairan di Provinsi Aceh. Pengambilan sampel penelitian ini berlangsung pada bulan Oktober 2018 - Januari 2019 bertempat Idi, Langsa, Abyda dan analisis DNA molekuler dilakukan pada bulan Januari - Maret 2019 bertempat di Laboratorium Yayasan Biodiversitas Indonesia, Denpasar, Bali. Analisis molekuler yang dilakukan yaitu tahapan ekstraksi DNA, Polymerase Chain Reaction, elektroforesis dan sekuensing. Hasil analisis secara molekuler didapatkan 33 sampel Thunnus tonggol dengan jarak genetik antar sampel yaitu 0.000 hingga 0.044 yang menunjukkan tingkat kekerabatan yang dekat antar sampel. Nilai keragaman haplotipe (Hd) Thunnus tonggol sebesar 0.99432 dan keragaman nukleotida (π) sebesar 0.02116. Nilai keragaman genetik yang tinggi menunjukkan bahwa Thunnus tonggol dari ketiga lokasi sampling memiliki kemampuan beradaptasi terhadap lingkungan yang dapat berubah sewaktu-waktu. Hasil penelitian ini dapat digunakan sebagai data dasar untuk perencanaan strategi konservasi genetik dan kebijakakan pengelolaan perikanan di Indonesia.

Longtail tuna (Thunnus tonggol) is one of the pelagic fish species that has oceanodromous characteristics which fully live and migrate in the sea. The population of T. tonggol lives in clear waters and in the neritic zone. Study about this species has not been intensively carried out in Indonesian waters, especially Aceh waters, so it is necessary to study the identification of morphology and genetic diversity. This study aimed to determine the genetic diversity of the T. tonggol population from several waters in Aceh Province. Sampling was done from October 2018 to January 2019 at 3 locations namely: Idi, Langsa, Abdya and molecular DNA analysis was carried out in January - March 2019 at the Bionesia Laboratory, Denpasar, Bali. The molecular analysis carried out several steps, DNA extraction, Polymerase Chain Reaction, electrophoresis and sequencing. The results of molecular analysis obtained 33 samples of T. tonggol with a genetic distance between samples ranging from 0.000 to 0.044 which indicates a close kinship between samples. The haplotype diversity (Hd) value of T. tonggol was 0.99432 and the nucleotide diversity (π) was 0.02116. The high value of genetic diversity indicates that T. tonggol from the three sampling locations has the ability to adapt to an environment that can change at any time. The results of this study can be used as basic data for planning genetic conservation strategies and fisheries management policies in Indonesia.