Faris Izzatur Rahman Primary Author mixed material bibliography Banda Aceh Fakultas MIPA (S1) 2022 id Indonesia

Skripsi

SARS-CoV-2 adalah virus yang berasal dari ordo Nidovirales, famili Coronaviridae dan subfamili Coronavirinae. Laju mutasi pada virus SARS-CoV-2 ditemukan sebanyak satu atau dua mutasi setiap bulannya. Mempelajari mutasi virus SARS-CoV-2 dapat membantu memahami bagaimana siklus evolusi dan hubungan kekerabatan dari virus tersebut. Studi yang dapat dilakukan untuk mempelajari mutasi adalah dengan menganalisis Single Nucleotide Polymorphism (SNP). Penelitian ini bertujuan mempelajari dan menganalisis SNP pada varian virus SARS-CoV-2 di Aceh. Penelitian ini menggunakan pendekatan Single Nucleotide Polymorphism Analysis untuk melihat mutasi yang terjadi pada 87 data sekuens virus SARS-CoV-2 Provinsi Aceh yang didapatkan dari GISAID. Hasil penelitian menunjukkan adanya 62 jenis varian yang terjadi pada data sekuens SARS-CoV-2 Provinsi Aceh dengan 60 jenis SNP dan 2 jenis delesi. Penelitian ini mendapatkan nilai rasio missense variant/silent variant (Ka/Ks) bernilai >1 yang bermakna seleksi mutasi telah bertindak untuk mengubah protein (positive selection). Validasi 44 jenis varian missense yang berhasil diidentifikasi dari hasil analisis terdeteksi pada mutasi asli varian Pango. ALGORITHMS - COMPUTER PROGRAMMING ANALYSIS OF VARIANCE 519.538 ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION Universitas Syiah Kuala 102136 2022-08-03 20:11:09 2022-08-04 09:46:14 machine generated