Electronic Theses and Dissertation

Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi aktivitas enzim selulase, mengkarakterisasi sifat biokimia, dan melakukan identifikasi molekuler gen 16S rRNA pada bakteri selulolitik IM16. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode deksriptif dan eksperimental. Parameter yang diamati adalah karakteristik aktivitas enzim selulase berdasarkan pengaruh konsentrasi substrat CMC dan suhu, karakteristik sifat biokimia berdasarkan Methyl Red (MR), Triplel Sugar Ironl Agar (TSIAl), Simmons citratel (SC), uji katalase, uji motilitas dan uji indol serta posisi gen 16S rRNA dari pohon filogenetik. Isolat yang digunakan adalah bakteri selulolitik IM16 dengan konsentrasi substrat enzim yang digunakan adalah 0,5%, 1%, 1,5%, 2% dan 2,5% serta variasi suhu enzim yang digunakan adalah 20oC, 37oC dan 40oC dengan masing-masing dua ulangan. Uji biokimia yang dilakukan meliputi uji Methyl Red (MR), uji Triple Sugar Iron Agar (TSIA), uji Simmons Citrate (SC), uji katalase, uji motilitas dan uji indol. Identifikasi molekuler gen 16S rRNA dilakukan untuk mengetahui kekerabatan IM16 dengan organisme lain melalui pohon filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi substrat CMC optimum aktivitas enzim selulase adalah sebesar 1% dengan suhu optimum untuk aktivitas enzim selulase adalah sebesar 37oC. Berdasarkan hasil uji biokimia diduga isolat bakteri selulolitik IM16 termasuk ke dalam genus Shigella. Berdasarkan hasil BLAST dan pohon filogenetik, isolat IM16 memiliki kekerabatan dengan Shigella sonnei strain CECT 4887 sebesar 99%.

Kata kunci: Bakteri selulolitik, enzim selulase, gen 16S rRNA, sifat biokimia.

The study aims to characterize cellulase enzyme activity, characterize biochemical properties and perform molecular identification of the 16S rRNA gene in IM16 cellulolytic bacteria. The method used in this study is an experimental method. The observed parameters are characteristics of cellulase enzyme activity based on the influence of CMC substrate concentration and temperature, biochemical properties characteristics based on Methyl Red (MR), Triplel Sugar Iron Agar (TSIAl), Simmons citratel (SC), catalase test, motility test and indol test as well as the position of the 16S rRNA gene of the phylogenetic tree. The isolates used are IM16 cellulolytic bacteria with concentrations of the enzyme substrate used are 0.5%, 1%, 1.5%, 2% and 2.5% and the temperature variations of the enzymes used are 20oC, 37oC and 40oC with two repeats each. Biochemical tests include methyl red (MR) test, Triple Sugar Iron Agar (TSIA) test, Simmons Citrate (SC) test, catalase test, motility test and marker test. Molecular identification of the 16S rRNA gene is carried out to determine the kinship of IM16 with other organisms through phylogenetic trees. The results showed that the optimum CMC substrate concentration of cellulase enzyme activity was 1% with the optimum temperature for cellulase enzyme activity being 37oC. Based on the results of biochemical tests, it is suspected that the isolate of cellulolytic bacteria IM16 belongs to the genus Shigella. Based on the results of BLAST and phylogenetic analysis, isolate IM16 was closely related to Shigella sonnei strain CECT 4887 by 99%. Keywords: Cellulolytic bacteria, cellulose enzymes, 16S rRNA genes, biochemical properties