Electronic Theses and Dissertation

Abstrak penelitian ini bertujuan untuk membandingkan kekerabatan pls 76 yang merupakan mikroorganisme termohalofilik - berdasarkan gen lipase dan mempelajari struktur lipase hasil translase gen secara bioinformatik. amplifikasi secara pcr menggunakan sepasang primer flip2-rlip2 menghasilkan gen lipase berukuran 1300 bp, yang sesuai dengan ukuran gen lipase secara umum. penjajaran urutan basa gen lipase pada ncbi menunjukkan bahwa pls 76 memiliki homologi tertinggi (98%) dengan geobacillus zalihae strain surf-189 dan geobacillus thermoleovorans strain artrw1. analisis filogenetik dengan menggunakan 27 mikroorganisme dengan homologi >90% menunjukkan bahwa pls 76 membentuk outgroup, mengindikasikan bahwa pls 76 merupakan mikroorganisme yang berbeda. lipase hasil translasi gen memiliki perbedaan 18 asam amino dengan tiga mikroorganisme pembanding. enzim ini memiliki sisi pentapeptida gly-xaa-ser-xaa-gly pada residu 194-198 dengan lubang oxyanion leu-thrp-thr-his-gly pada residu 60-65. hasil ini mengindikasikan bahwa lipase pls 76 termasuk kedalam lipase sub-famili 1.5. pemodelan struktur menunjukkan bahwa lipase pls 76 memiliki struktur monomer dengan dengan satu ion ca2+. kata kunci: lipase, pls 76, sub-famili 1.5, structural modelling