Electronic Theses and Dissertation

Abstrak lipase merupakan enzim yang memiliki spektrum aplikasi yang luas dalam bidang industri. penelitian ini bertujuan untuk mengamplifikasi gen lipase, prediksi struktur, dan menentukan golongan lipase pls 80. isolasi gen lipase pls 80 dilakukan menggunakan metode zhou, dengan lisis sel secara mekanik dan secara kimiawi serta amplifikasi menggunakan metode pcr dengan dua pasang primer. hasil amplifikasi gen lipase menggunakan primer internal adalah 326 bp dan primer eksternal 1246 bp. hasil analisis sekuens gen lipase pada ncbi menunjukan kedekatan 99% dengan geobacillus thermoleovarans, namun berdasarkan analisis pohon filogenetik pls 80 membentuk cabang terpisah dalam satu mono-filetik. hasil terjemahan asam amino dari pls 80 dengan mikroorganisme lain memiliki 14 perbedaan atau sekitar 2% dari jumlah keseluruhan asam amino. hasil penjajaran asam amino pls 80 menunjukan sisi katalitik ala-his-ser-gln-gly. struktur permodelan protein pls 80 memiliki kesamaan struktur dengan geobacillus zilahae t1 yang memiliki bentuk struktur homo-dimer, dengan dua ion ca2+ dan dua ion zn2+. berdasarkan hasil yang diperoleh menyatakan gen lipase pls 80 merupakan spesies baru dari genus geobacillus, merupakan lipase subfamily 1.5, dan memiliki struktur protein homo-dimer dengan dua ion ca2+ dan zn2+. kata kunci: pria laot sabang 80, pls 80, lipase, amplifikasi, geobacillus. ? abstract lipase is an enzyme that has wide application spectrum in the industrial field. this research aims to amplify lipase gene, predict of the structure, and determine lipase groups from thermo-halophilic bacteria isolate pls 80. isolation of pls 80 lipase gene was carried out with the zhou method, mechanical and chemical cell lysis and amplification with pcr method using two pairs of primer. the result of lipase gen amplification using internal primer were 326 bp and 1246 bp by using external primer. the lipase gene sequence analysis on ncbi shows 99% of similarity to geobacillus thermoleovarans, but for phylogenetic tree, pls 80 form a separated branch in one monophyletic. the amino acids translation of the pls 80 with other microorganisms has 14 differences or about 2% of the total amino acids. the result of pls 80 amino acid alignment shows catalytic site of ala-his-ser-gln-gly. modeling structure of pls 80 protein has a similarity with geobacillus zilahae t1 which has a homodimer structure with two ca2+ ions and two zn2+ ions. base on the obtained results, lipase gene pls 80 is a new species of geobacillus genus which is a lipase subfamily 1.5 and has a homodimer protein structure with two of both ca2+ dan zn2+ ions. keywords: pria laot sabang 80, pls 80, lipase, amplification, geobacillus.