Universitas Syiah Kuala | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    SKRIPSI
MUHAMMAD RAHMAT AL ANSORI, DETECTION OF CTX-M, TEM, AND SHV GENES ENCODING EXTENDED SPECTRUM B-LACTAMASE ENZYMES IN ESCHERICHIA COLI BACTERIA FROM BROILER CHICKEN MEAT. Banda Aceh Fakultas Kedokteran Hewan,2026

Escherichia coli (e. coli) penghasil enzim extended spectrum b-lactamase (esbl) merupakan ancaman utama keamanan pangan daging ayam broiler, dengan gen ctx-m, tem, dan shv sebagai kelompok yang paling sering dilaporkan, di mana ctx-m mendominasi kasus global dan nasional serta tem dan shv kini juga banyak ditemukan bersamaan pada isolat pangan hewani. penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi keberadaan gen ctx-m, tem, dan shv pada e. coli yang diisolasi dari daging ayam broiler yang dijual di salah satu pasar tradisional di banda aceh. proses identifikasi gen dilakukan menggunakan teknik polymerase chain reaction (pcr) dengan primer spesifik untuk masing-masing gen target. produk amplifikasi kemudian diverifikasi melalui elektroforesis gel agarosa untuk memastikan panjang fragmen dna yang dihasilkan sesuai dengan ukuran yang telah dilaporkan dalam literatur. hasil analisis menunjukkan bahwa sampel yang diuji memperlihatkan keberadaan dari ketiga gen tersebut. visualisasi elektroforesis menampilkan pita dna pada ukuran 867 bp untuk gen tem, dan shv kemudian 593 bp untuk gen ctx-m. hasil analisis konsisten dengan literatur, menandakan bahwa gen ctx-m, tem, dan shv berhasil terdeteksi. temuan ini mengindikasikan bahwa e. coli penghasil esbl telah terdeteksi pada rantai pasok daging ayam broiler di lokasi penelitian. kehadiran gen-gen penyandi esbl pada produk unggas mengisyaratkan adanya celah serius dalam penerapan higienitas, sanitasi, dan pengawasan biosekuriti selama proses produksi hingga pemasaran. kata kunci: ctx-m, esbl, escherichia coli, shv, tem.



Abstract

Escherichia coli (E. coli) producing Extended Spectrum B-Lactamase (ESBL) enzymes represents a major food safety concern in broiler chicken meat, with the CTX-M, TEM, and SHV gene families being the most frequently reported, where CTX-M predominates globally and nationally, and TEM and SHV are increasingly identified together in animal-derived isolates. This study aimed to determine the presence of CTX-M, TEM, and SHV genes in E. coli isolated from broiler chicken meat sold in a traditional market in Banda Aceh. Gene detection was carried out using Polymerase Chain Reaction (PCR) with specific primers designed for each target gene. The resulting amplicons were subsequently verified through agarose gel electrophoresis to confirm that the fragment lengths corresponded to reference sizes reported in the literature. The analysis revealed that the examined samples carried all three ESBL-associated genes. Electrophoresis visualization showed DNA bands at 867 bp for TEM and SHV gene, furthermore 593 bp for CTX-M gene, consistent with reference data, indicating successful detection of CTX-M, TEM, and SHV. These findings suggest that ESBL-producing E. coli is already detected within the broiler meat supply chain in the study area. The occurrence of ESBL genes in poultry products signals significant gaps in hygiene and sanitation practice, and biosecurity monitoring throughout the production and distribution processes. Keywords: CTX-M, ESBL, Escherichia coli, SHV, TEM.



    SERVICES DESK