Electronic Theses and Dissertation

Eksplorasi bakteri termo-halofilik dari lingkungan fumarol laut dalam (deep sea vent) bertujuan untuk menemukan spesies mikroba unik yang berpotensi menghasilkan senyawa antibiotik baru. penelitian ini mengidentifikasi bakteri termo-halofilik isolat pls 54 melalui analisis filogenetik gen groel dan menentukan medium optimum untuk produksi antibiotik. gen groel diamplifikasi menggunakan metode polymerase chain reaction (pcr) dengan primer a, menghasilkan fragmen berukuran sekitar 1500 bp. hasil sekuensing menunjukkan fragmen sepanjang ±1242 bp (area consereved dan variabael) dengan tingkat homologi sebesar 98,15% terhadap bacillus sp. ms berdasarkan data ncbi. analisis filogenetik menunjukkan bahwa fragmen sepanjang ±1242 bp dan ±280 bp (area variabael) memiliki hubungan kekerabatan terdekat dengan bacillus sp. ms, sedangkan fragmen sepanjang ±288 bp dan ±697 bp (area consereved) memiliki hubungan kekerabatan dengan geobacillus thermocatenulatus. optimasi produksi antibiotik menggunakan tiga jenis medium, yaitu tryptic soy broth (tsb), m9, dan zobell marine broth (zmb), menunjukkan bahwa medium m9 merupakan medium paling efektif dengan zona hambat masing-masing sebesar 8,2 mm dan 14,05 mm terhadap escherichia coli dan staphylococcus aureus setelah fermentasi selama 96 dan 120 jam. penelitian ini menunjukkan bahwa isolat pls 54 memiliki perbedaan hubungan filogenetik bergantung pada daerah gen groel yang dianalisis serta bahwa medium m9 mendukung produksi antibiotik secara optimal. kata kunci: bakteri termo - halofilik, gen groel, antibiotik, pls 54.

The exploration of thermo-halophilic bacteria from deep-sea fumarole (Deep Sea Vent) environments aims to discover unique microbial species with the potential to produce novel antibiotic compounds. This study identified the thermo-halophilic bacterium isolate PLS 54 through phylogenetic analysis of the groEL gene and determined the optimal medium for antibiotic production. The groEL gene was amplified using the Polymerase Chain Reaction (PCR) method with primer A, generating a fragment of approximately 1500 bp. Sequencing results revealed a fragment of about 1242 bp (conserved and variabel area) that exhibited 98.15% homology to Bacillus sp. MS based on NCBI data. Phylogenetic analysis indicated that fragments of approximately 1242 bp and 280 bp (variabel area) showed the closest relationship to Bacillus sp. MS, while fragments of 288 bp and 697 bp (conserved area) were closely related to Geobacillus thermocatenulatus. Optimization of antibiotic production using Tryptic Soy Broth (TSB), M9, and Zobell Marine Broth (ZMB) media demonstrated that M9 was the most effective, producing inhibition zones of 8.2 mm and 14.05 mm against Escherichia coli and Staphylococcus aureus after 96 and 120 hours of fermentation, respectively. These findings indicate that isolate PLS 54 exhibits distinct phylogenetic relationships depending on the analyzed groEL region and that M9 medium supports optimal antibiotic production. Keywords: Thermo – Halophilic Bacteria, groEL Gene, Antibiotic, PLS 54.