Universitas Syiah Kuala | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    SKRIPSI
KHALILAH NAJWA, KARAKTERISTIK GENETIK DUA SPESIES IKAN DECAPTERUS DI PERAIRAN ACEH. Banda Aceh Fakultas Kelautan dan perikanan,2025

Ikan layang (decapterus) merupakan salah satu ikan pelagis kecil yang termasuk ke dalam famili carangidae yang memiliki 30 genus dan 147 spesies di dunia dan tersebar di perairan tropis dan subtropis. ikan decapterus macarellus dan decapterus maruadsi termasuk dalam ikan yang umumnya didaratkan di perairan simeulue dan langsa. tingginya minat masyarakat terhadap ikan ini menyebabkan overfishing dan kerusakan stok ikan. oleh karena itu, diperlukan pengelolaan yang baik melalui pendataan ikan melalui identifikasi karakter morfologi dan karakteristik genetik. tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi karakteristik morfometrik dan karakteristik genetik pada ikan d. maruadsi dan d. macarellus di perairan aceh serta dapat menghasilkan referensi berdasarkan sekuen dna mitokondria cytochrome oxidase subunit i (coi). penelitian ini dilakukan pada bulan januari 2025 sampai dengan juli 2025. sebanyak 8 sampel ikan decapterus dikoleksi dari tpi simeulue dan tpi langsa untuk analisis morfometrik dan analisis genetik menggunakan gen coi. analisis morfometrik menunjukkan karakter panjang sirip dorsal (dfbl), panjang standar (sl) dan lebar badan (bd) decapterus maruadsi lebih panjang dari decapterus macarellus. seluruh sampel berhasil disekuensing dengan panjang 654 base pairs (bp). sebanyak dua spesies ikan berhasil diidentifikasi yaitu ikan decapterus macarellus dan decapterus maruadsi. hasil analisis kemiripan blast dan bold menunjukkan nilai yang tinggi yaitu berkisar antara 99.08-100%. jarak genetik intraspesies berkisar antara 0,01–0.1%. hasil penelitian ini hasil analisis morfometrik dan molekuler, dapat disimpulkan bahwa meskipun decapterus maruadsi dan decapterus macarellus menunjukkan kemiripan dalam beberapa parameter morfometrik dan komposisi basa nukleotida yang didominasi at pada sekuens dna mitokondria menunjukkan kecenderungan adaptasi genetik pada ikan terhadap lingkungan yang kompleks, yang secara tidak langsung dapat memengaruhi karakter morfologis melalui regulasi genetik. kata kunci : ikan layang, dna barcoding, coi, morfometrik, perairan aceh.



Abstract

Swallowfish (Decapterus) is one of the small pelagic fishes included in the Carangidae family which has 30 genera and 147 species in the world and is distributed in tropical and subtropical waters. Decapterus macarellus and Decapterus maruadsi are among the fish commonly landed in Simeulue and Langsa waters. The high public interest in these fish has led to overfishing and damage to fish stocks. Therefore, good management is needed through data collection of fish through the identification of morphological characteristics and genetic characteristics. The purpose of this study was to identify morphometric characteristics and genetic characteristics of D. maruadsi and D. macarellus in Aceh Waters and to produce a reference based on the Mitochondrial DNA sequence Cytochrome Oxidase Subunit I (COI). This research was conducted from January 2025 to July 2025. A total of 8 Decapterus fish samples were collected from TPI Simeulue and TPI Langsa for morphometric analysis and genetic analysis using the COI gene. Morphometric analysis showed the characters of dorsal fin length (DFBL), standard length (SL) and body width (BD) of Decapterus maruadsi were longer than Decapterus macarellus. All samples were successfully sequenced with a length of 654 base pairs (bp). A total of two fish species were identified, namely Decapterus macarellus and Decapterus maruadsi. BLAST and BOLD similarity analysis results showed high values ranging from 99.08-100%. Intraspecies genetic distance ranged from 0.01-0.1%. The results of this study from morphometric and molecular analyses, it can be concluded that although Decapterus maruadsi and Decapterus macarellus show similarities in several morphometric parameters and AT-dominated nucleotide base composition in mitochondrial DNA sequences indicate a tendency for genetic adaptation in fish to complex environments, which can indirectly affect morphological characters through genetic regulation. Keywords : Swallowfish, DNA barcoding, COI, morphometrics, Aceh waters.



    SERVICES DESK