Universitas Syiah Kuala | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    THESES
Tiara Fadila Alzahra, IDENTIFIKASI SAPI ACEH CALON BIBIT DENGAN MENGGUNAKAN ANALISIS GEN PITUITARY SPESIFIC TRANSCRIPSION FACTOR-1 LOKUS PIT-1-HINFL. Banda Aceh Fakultas Pertanian (S2),2025

Gen pituitary-specific transcription factor-1 (pit-1), salah satu gen yang dapat mengontrol sifat produksi dan kualitas pada ternak. dengan mendeteksi keragaman gen pit-1 pada lokus pit-1-hinf1 dan pengaruhnya terhadap bobot badan induk dan produksi susu pada sapi aceh. melalui seleksi gen pit-1 ini diharapkan dapat menjadi pedoman dalam seleksi pemurnian sapi aceh untuk mendapatkan sifat genetik sapi dual purpose dan menurunkan tingkat kematian pedet serta meningkatkan pertumbuhan pedet pada periode menyusui dan bobot sapih. sampel yang digunakan adalah 8 sampel darah sebagai sumber dna yang dikumpulkan dari sapi lokal aceh di beberapa kabupaten. metode yang digunakan adalah polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (pcr-rflp) yang diawali dengan ekstraksi dna, pcr, kemudian amplifikasi dna dengan enzim restriksi hinfi. untuk menentukan genotipe pit1 dan variasi alel. setelah proses genotyping, frekuensi genotipe dan alel dihitung. hasil penelitian menunjukkan bahwa 1 jenis genotipe pit1 yaitu bb dengan frekuensi 1. tipe alel yang ditemukan adalah b dan b, dengan frekuensi masing-masing 1 dan 1. berdasarkan penelitian ini dapat disimpulkan bahwa tidak terdapat keragaman gen pit1|hinfl pada sapi aceh. genotipe yang terdapat pada dna sapi aceh adalah genotipe bb dengan frekuensi alel adalah tipe b, keseragaman ini dapat mengindikasikan bahwa sapi-sapi aceh yang dipilih masih murni karena pelestariannya sangat terjaga, dengan demikian pit-1|hinfl belum dapat digunakan sebagai penanda genetik untuk mencari rumpun sapi aceh sebagai sapi perah dengan jumlah sampel yang kecil, namun demikian pit-1|hinfl dapat digunakan pada sapi aceh apabila digunakan jumlah sampel yang lebih banyak, sehingga memungkinkan adanya keragaman dan mendapatkan informasi atau hasil yang lebih luas.



Abstract

The Pituitary-Specific Transcription Factor-1 (Pit-1) gene is one of the genes that can control the production characteristics and quality of milk in livestock. The detection of variations in the Pit-1 gene at the Pit-1-Hinf locus is expected to provide insights into the potential of Aceh cattle to become dairy cattle and serve as a guide in selecting dual genetic traits in Aceh cattle. The samples used were 8 blood samples consisting of 4 male Aceh cattle and 4 female Aceh cattle as sources of DNA taken from local Aceh cattle in several districts. The method used was Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), starting with DNA extraction, PCR, and then amplification of DNA with the restriction enzyme HinfI. To determine the genotype of PIT1 and allele variations. After the genotyping process, the genotype and allele frequencies are calculated. The research results show that there is 1 type of genotype PIT1, namely BB with a frequency of 1. The alleles found are B and B, each with a frequency of 1. Based on this research, it can be concluded that there is no genetic diversity of Pit-1|Hinfl in aceh cattle, as only the BB genotype was found. This indicates that selected Aceh cattle remain in pure condition as beef cattle types and have not shown their potential as dairy cattle types. Thus, Pit-1|Hinfl cannot yet be used as a genetic marker to search for aceh cattle as dairy cows with a small sample size; however, Pit-1|Hinfl can be used on aceh cattle if a larger sample size is used, allowing for diversity and obtaining further information



    SERVICES DESK