Electronic Theses and Dissertation

Abstrak siput air tawar (faunus ater) merupakan salah satu bahan baku pangan yang terdapat di wilayah aceh yang dimanfaatkan sebagai lauk tambahan dalam sayur. berdasarkan cara hidupnya siput faunus ater yang memanfaatkan nutrisi secara menyaring (filter feeder) memungkinkan potensi tercemar berbagai macam jenis bakteri. penelitian ini bertujuan untuk mengindentifikasi bakteri escherichia coli menggunakan analisis gen 16s rrna pada siput air tawar (faunus ater) di sungai leupung, saney dan gle bruek aceh besar. penelitian ini dilakukan dengan mengisolasi bakteri pada media brain heart infusion broth (bhib), eosin methylen blue agar (emba) dan pewarnaan gram, serta dilakukan uji molekuler menggunakan analisis gen 16s rrna. hasil penelitian terihat warna keruh pada media bhib, terdapat koloni bewarna hijau metalik berbentuk bulat pada media emba, secara pewarnaan gram menunjukkan gram negatif berbentuk batang pendek. hasil analisis molekuler berupa parsial gen 16s rrna menunjukkan tingkat kemiripan sebesar 99,73% dan nilai query coverage 100% dengan bakteri escherichia coli. secara konstruksi pohon filogenetik menunjukkan letak cabang dan nilai bootstrap kekerabatan terdekat isolat mz-02 dimiliki oleh bakteri escherichia coli 16s ribosomal rna complete sequence dengan nilai boostrap sebesar 99. kesimpulan penelitian ini pada siput air tawar (faunus ater) ditemukan adanya bakteri escherichia coli yang hidup di sungai saneey kecamatan leupung

ABSTRACT Freshwater snail (Faunus ater) is one of the food raw materials found in the Aceh region which is used as an additional side dish in vegetables. Based on the way of life of Faunus ater snails that utilize nutrients by filtering (filter feeder) allows the potential to be contaminated with various types of bacteria. This study aims to identify Escherichia coli bacteria using 16S rRNA gene analysis in freshwater snails (Faunus ater) in the Leupung, Saney and Gle bruek rivers of Aceh Besar. This study was conducted by isolating bacteria on Brain Heart Infusion Broth (BHIB) media, Eosin Methylen Blue Agar (EMBA) and Gram staining, and molecular testing using 16S rRNA gene analysis. The results of the study showed a cloudy color on BHIB media, there were round metallic green colonies on EMBA media, Gram staining showed a short rod-shaped Gram negative. The results of molecular analysis in the form of partial 16S rRNA gene showed a similarity level of 99.73% and a Query Coverage value of 100% with Escherichia coli bacteria. The phylogenetic tree construction shows the location of the branches and the bootstrap value of the closest kinship of isolate MZ-02 owned by Escherichia coli bacteria 16S ribosomal RNA complete sequence with a boostrap value of 99. The conclusion of this study in the Saneey River, Leupung District, found the presence of Escherichia coli bacteria in freshwater snails (Faunus ater).