Electronic Theses and Dissertation

Tanaman nilam aceh (pogostemon cablin benth.) merupakan tanaman yang memiliki kandungan minyak atsiri atau biasa dikenal dengan minyak nilam, yang memiliki beragam aktivitas farmakologis, termasuk potensi sebagai agen antikanker. salah satu senyawa utamanya, patchouli alcohol, diketahui memiliki sifat antioksidan, antiinflamasi, dan kemampuan menghambat proliferasi sel kanker. kanker melanoma merupakan salah satu jenis kanker kulit yang agresif, ditandai oleh tingkat proliferasi dan metastasis yang tinggi, serta angka mortalitas yang signifikan. penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi potensi senyawa aktif minyak nilam aceh dalam menghambat proliferasi sel kanker melanoma melalui pendekatan in silico. sebanyak 63 senyawa aktif hasil analisis gc-ms digunakan untuk mengidentifikasi protein target yang relevan dengan jalur proliferasi sel melanoma. hasil analisis menunjukkan bahwa senyawa aktif dalam minyak nilam aceh memiliki potensi sebagai agen antikanker dengan menargetkan protein pik3ca. berdasarkan hasil molecular docking, dua senyawa yang menunjukkan interaksi terbaik terhadap protein pik3ca adalah senyawa aciphyllene dan patchouli alcohol, yang didasarkan pada nilai binding energy, keberadaan ikatan hidrogen dan persentase kesamaan residu asam amino dengan obat kontrolnya. namun berdasarkan hasil uji mds stabilitas ligan dan protein yang disimulasikan selama 50 ns menunjukkan bahwa senyawa patchouli alcohol memiliki stabilitas yang cukup baik dengan protein target dibandingkan dengan aciphyllene. penelitian ini menyimpulkan bahwa senyawa patchouli alcohol yang berasal dari minyak nilam memiliki potensi sebagai inhibitor pik3ca, sehingga penelitian ini diharapkan dapat dilanjutkan pada kajian in vitro untuk membuktikan jalur mekanisme molekuler yang dilalui oleh minyak nilam sebagai agen antikanker melanoma. kata kunci : in silico, kanker melanoma, minyak nilam, pik3ca.

Acehnese Patchouli (Pogostemon cablin Benth.) is a plant that produces essential oil, commonly known as patchouli oil, which exhibits various pharmacological activities, including potential anticancer properties. Patchouli alcohol, a primary compound, exhibits antioxidant and anti-inflammatory properties and can inhibit the proliferation of cancer cells. The melanoma cancer is one of the aggressive types of skin cancer characterized by high proliferation and metastasis rates as well as significant mortality rates. This study aims to explore the potential of Aceh Patchouli Oil active compounds in inhibiting melanoma cancer cell proliferation through in silico approach. A total of 63 active compounds from GC-MS analysis were used to identify target proteins relevant to the melanoma cell proliferation pathway. The analysis showed that the compounds in aceh patchouli oil have anticancer potential by targeting PIK3CA protein. Based on the molecular docking results, the two compounds that showed the best interaction with the PIK3CA protein were aciphyllene and patchouli alcohol, based on the binding energy value, the presence of hydrogen bonds, and the percentage of amino acid residue similarity to the control drug. Based on the MDS test results, the stability of ligands and proteins simulated for 50 ns indicates that the patchouli alcohol compound shows relatively good stability with the target protein compared to aciphyllene. This study concludes that patchouli alcohol compounds from patchouli oil could potentially act as PIK3CA inhibitors. Therefore, this research is expected to be continued in in vitro studies to clarify the molecular mechanisms by which patchouli oil acts as an anticancer agent against melanoma. Keywords : In silico, melanoma cancer, patchouli oil, PIK3CA.