Electronic Theses and Dissertation

Nilam aceh (pogostemon cablin (blanco) benth.) termasuk salah satu tanaman penghasil minyak atsiri. sebagian besar petani nilam menggunakan bibit dari varietas unggul untuk membudidayakan tanaman nilam, namun petani di kecamatan lhoong melakukan pembudidayaan nilam menggunakan bibit yang ditanam secara turun temurun. tanaman nilam tersebut telah dinyatakan sebagai nilam aceh, tetapi belum dapat diverifikasi secara langsung sehingga tidak dapat dipastikan hubungan kekerabatannya. penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan tanaman nilam varietas lokal yang terdapat di kecamatan lhoong, kabupaten aceh besar dengan tiga varietas unggul yaitu tapaktuan, lhokseumawe dan sidikalang, merekontruksi dan menganalisis pohon filogenetik pogostemon cablin (blanco) benth. berdasarkan gen its. penelitian ini menggunakan metode deskriptif yang meliputi beberapa tahapan. tahapan penelitian dimulai dengan ekstraksi dna menggunakan metode ctab, amplifikasi dna menggunakan gen its, sequencing, penyejajaran hasil sequencing dan kontruksi pohon filogeni menggunakan mega x dengan metode maximum parsimony serta bootstrap sebanyak 1000 pengulangan. hasil penelitian menunjukkan ukuran dna hasil amplifikasi dengan gen its untuk varietas lokal dan varietas unggul adalah 650 bp. hasil penyejajaran sekuens dibandingkan dengan data yang diperoleh dari genbank. berdasarkan hasil kontruksi pohon filogeni menggunakan gen its menunjukkan bahwa sampel nilam varietas lokal yang terdiri dari geunteut (gt), lamsujen (lj) dan pudeng (pd) memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan varietas unggul yang terdiri dari tp1, sd1, lh1, lh2 dan lh3 dengan didukung jarak genetik yaitu 0,0000, sedangkan nilam varietas lokal sampel krueng kala (kk) memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan varietas unggul sampel sd2 didukung dengan jarak genetik sebesar 0,0031. kata kunci: filogenetik, gen its, pogostemon cablin (blanco) benth., varietas lokal

Aceh patchouli (Pogostemon cablin (Blanco) Benth.) is one of the essential oil producing plants. Most patchouli farmers use shoot cuttings from superior varieties to cultivate patchouli plants, but farmers in Lhoong District cultivate patchouli using shoot cuttings that have been planted for generations. The patchouli plant has been declared as patchouli aceh, but it has not been verified directly so that the kinship relationship cannot be ascertained. This study aims to determine the kinship of local patchouli varieties found in Lhoong District, Aceh Besar Regency with three superior varieties namely tapaktuan, lhokseumawe and sidikalang, reconstruct and analyze the phylogenetic tree of Pogostemon cablin (Blanco) Benth. based on ITS genes. This research uses a descriptive method which includes several stages. The research stages began with DNA extraction using the CTAB method, DNA amplification using the ITS gene, sequencing, alignment of sequencing results and phylogeny tree construction using MEGA X with the Maximum Parsimony method and bootstrap of 1000 repetitions. The results showed that the size of DNA amplified with ITS genes for local varieties and superior varieties was 650 bp. Sequence alignment results were compared with data obtained from GenBank. Based on the results of phylogeny tree construction using the ITS gene, it shows that the local variety patchouli samples consisting of Geunteut (GT), Lamsujen (LJ) and Pudeng (PD) have a close kinship with superior varieties consisting of TP1, SD1, LH1, LH2 and LH3 supported by a genetic distance of 0.0000, while the local variety patchouli sample Krueng Kala (KK) has a close kinship with the superior variety sample SD2 supported by a genetic distance of 0.0031. Keywords: phylogenetic, ITS gene, Pogostemon cablin (Blanco) Benth., local variety