PENGUJIAN IN SILICO TANAMAN COFFEA SPP. DAN ARECA CATECHU L. TERHADAP HEPATITIS, HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV), TUBERCULOSIS (TBC), KANKER KULIT, DAN KANKER PAYUDARA | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    SKRIPSI

PENGUJIAN IN SILICO TANAMAN COFFEA SPP. DAN ARECA CATECHU L. TERHADAP HEPATITIS, HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV), TUBERCULOSIS (TBC), KANKER KULIT, DAN KANKER PAYUDARA


Pengarang

Dian Purnama Putri - Personal Name;

Dosen Pembimbing

Elly Sufriadi - 197103302000121001 - Dosen Pembimbing I
Sheilatina - 197808052003122001 - Dosen Pembimbing II



Nomor Pokok Mahasiswa

2008103010040

Fakultas & Prodi

Fakultas MIPA / Kimia (S1) / PDDIKTI : 47201

Subject
-
Kata Kunci
-
Penerbit

Banda Aceh : Fakultas mipa., 2024

Bahasa

No Classification

-

Literature Searching Service

Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)

Keanekaragaman tumbuhan yang ada di Indonesia diperkirakan memiliki 25% dari spesies tumbuhan berbunga yang ada di dunia atau merupakan urutan negara terbesar ketujuh dengan jumlah spesies mencapai 20.000 spesies. Keanekaragaman hayati yang terdapat di Ekosistem Leuser sangat tinggi, unik, dan lengkap sehingga disebut sebagai salah satu keajaiban warisan dunia yang secara administratif kawasan ini meliputi wilayah Provinsi Aceh dan Provinsi Sumatera Utara. Kawasan Ekosistem Leuser merupakan satu kesatuan wilayah yang terbentang luas didalamnya terdapat berbagai jenis tanaman yang telah digunakan sebagai bahan obat tradisional. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi potensi senyawa metabolit sekunder yang terkandung dalam Coffea spp. dan Areca catechu L. sebagai inhibitor terhadap penyakit seperti hepatitis, Human Immunodeficiency Virus (HIV), Tuberculosis (TBC), kanker kulit dan kanker payudara menggunakan metode in silico melalui pendekatan molecular docking. Studi ini menggunakan data KNApSAcK untuk memperoleh senyawa dari kedua tumbuhan tersebut. Senyawa-senyawa metabolit tersebut dipreparasi dan diuji secara in silico, termasuk pengujian Lipinski‟s Rule of Five dengan website SWISSADME dan molecular docking menggunakan perangkat lunak PyRx dan BIOVIA Discovery Visualizer 2021 untuk menghitung nilai binding affinity. Hasil penelitian menunjukkan bahwa senyawa Caffeoyltryptophan dari spesies Coffea spp. memiliki potensi sebagai daya hambat protein TBC 6R9W dengan nilai binding affinity sebesar -9.1 kkal/mol serta memiliki potensi sebagai daya hambat protein kanker kulit 2VCJ dengan nilai binding affinity sebesar -8.2 kkal/mol. Caffestol dari spesies Coffea spp. memiliki potensi sebagai daya hambat protein kanker payudara 3ERT dengan nilai binding affinity sebesar -8.2 kkal/mol dan Caffeine dengan nilai binding affinity -8.3 kkal/mol. Selain itu, senyawa (+)Catechin dari spesies Areca catechu L. memiliki potensi sebagai daya hambat protein TBC 6R9W dengan nilai binding affinity sebesar -9.4 kkal/mol serta memiliki potensi sebagai daya hambat protein kanker kulit 2VCJ dengan nilai binding affinity sebesar -8.2 kkal/mol. (+)-Catechin dan Arecoline dari spesies Areca catechu L. juga memiliki potensi sebagai daya hambat protein kanker payudara 3ERT dengan nilai binding affinity sebesar -9 kkal/mol. Berdasarkan hasil ini, senyawa-senyawa tersebut memiliki potensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai kandidat obat untuk penyakit-penyakit terkait.

Kata kunci: Coffea, Areca catechu, Hepatitis, HIV, TBC, Kanker kulit, Kanker payudara, In Silico, Molecular Docking

Plant diversity in Indonesia is estimated to have 25% of the world's flowering plant species or the seventh largest country with over 20,000 species. The biodiversity of the Leuser Ecosystem is so high, unique and complete that it is considered one of the wonders of the world's heritage. Administratively, this area covers the provinces of Aceh and North Sumatra. The Leuser Ecosystem is a vast area that contains a variety of plants that have been used as traditional medicinal ingredients. This study aims to identify the potential of secondary metabolite compounds contained in the Coffea spp. and Areca catechu L. as inhibitors against diseases such as hepatitis, Human Immunodeficiency Virus (HIV), tuberculosis (TB), skin cancer and breast cancer using in silico methods through molecular docking approaches. This study used KNApSAcK data to obtain compounds from both. The metabolite compounds were prepared and tested in silico, including Lipinski's Rule of Five testing with the SWISSADME website and molecular docking using PyRx and BIOVIA Discovery Visualizer 2021 software to calculate binding affinity values. The results showed that Caffeoyltryptophan compounds from the of Coffea spp. species have potential as an inhibitor of TBC protein 6R9W with a binding affinity value of -9.1 kcal/mol and have potential as an inhibitor of skin cancer protein 2VCJ with a binding affinity value of -8.2 kcal/mol. Caffestol from the of Coffea spp. species has the potential to inhibit breast cancer protein 3ERT with a binding affinity value of -8.2 kcal/mol and Caffeine with a binding affinity value of -8.3 kcal/mol. In addition, (+)-Catechin compounds from Areca catechu L. species have the potential to inhibit TBC protein 6R9W with a binding affinity value of -9.4 kcal/mol and have the potential to inhibit skin cancer protein 2VCJ with a binding affinity value of -8.2 kcal/mol. (+)-Catechin and Arecoline from species Areca catechu L. also have potential as an inhibitor of breast cancer protein 3ERT with a binding affinity value of -9 kcal/mol. Based on these findings, these compounds have potential to be further developed as candidate drugs for related diseases. Keywords: Coffea, Areca catechu, Hepatitis, HIV, TB, Skin cancer, Breast cancer, In Silico, Molecular Docking

Citation



    SERVICES DESK