Electronic Theses and Dissertation
Universitas Syiah Kuala
SKRIPSI
STUDI MOLECULAR DOCKING SENYAWA AKTIF TUMBUHAN KAWASAN MANIFESTASI GEOTERMAL SEULAWAH AGAM IE JUE TERHADAP PROTEIN SARS-COV-2
Pengarang
Salaswati - Personal Name;
Dosen Pembimbing
Rinaldi Idroes - 196808251994031003 - Dosen Pembimbing I
Khairan - 197506222005011001 - Dosen Pembimbing I
Nomor Pokok Mahasiswa
1908103010020
Fakultas & Prodi
Fakultas MIPA / Kimia (S1) / PDDIKTI : 47201
Subject
Kata Kunci
Penerbit
Banda Aceh : Fakultas MIPA Kimia., 2024
Bahasa
No Classification
-
Literature Searching Service
Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)
Studi molecular docking senyawa aktif tumbuhan kawasan Manifestasi Geotermal Seulawah Agam (MGSA) Ie Jue terhadap protein Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) dan penanganan pada keadaan sindrom badai sitokin telah dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan senyawa aktif dari tumbuhan MGSA Ie Jue yang memiliki potensi terapetik terhadap protein SARS-CoV-2 yaitu main protease (Mpro) dan papain-like protease (PLpro) serta sitokin pro-inflamasi yaitu interleukin-1 (IL-1) dan interleukin-6 (IL-6) dengan simulasi molecular docking. Sampel tumbuhan dari kawasan MGSA Ie Jue yang dikumpulkan sebanyak empat sampel yaitu Blumea balsamifera L. (DC)., Tephrosia noctiflora Baker, Ocimum americanum L., dan Ziziphus rufula Miq. Sampel tumbuhan dimaserasi dengan etanol 96% dan dianalisis senyawa yang terkandung di dalam ekstrak etanol tersebut menggunakan Gas-Chromatography Mass-Spectrometry (GC-MS). Senyawa hasil GC-MS yang berpotensi sebagai kandidat obat dilakukan pengujian Lipinski’s Rule of Five (Ro5), kemudian dilakukan proses docking menggunakan Autodock Vina dalam perangkat lunak emulator PyRx dan hasilnya divisualisasikan menggunakan BIOVIA Discovery Visualizer 2021. Hasil dari analisis molecular docking menunjukkan bahwa senyawa lupenone, stigmasterol, lupeol, dan cholesta-22,24-dien-5-ol, 4,4-dimethyl- memiliki nilai binding affinity yang mendekati dan lebih rendah terhadap reseptor target dibandingkan dengan kontrol positifnya. Berdasarkan hal tersebut, dapat disimpulkan bahwa senyawa aktif dari tumbuhan kawasan MGSA Ie Jue memiliki potensi terapetik terhadap protein SARS-CoV-2 serta sitokin pro-inflamasi.
Kata kunci: MGSA Ie Jue, SARS-CoV-2, Molecular Docking
Molecular docking studies of active compounds from plants in the Ie Jue Manifestation of Geothermal Seulawah Agam (MGSA) area against Severe Acute Respiratory Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) proteins and treatment of cytokine storm syndrome conditions have been carried out. This research aims to determine active compounds from plants in the Ie Jue MGSA which have therapeutic potential against SARS-CoV-2 proteins, namely main protease (Mpro) and papain-like protease (PLpro) as well as pro-inflammatory cytokines, namely interleukin-1 (IL-1) and interleukin-6 (IL-6) with molecular docking simulations. Four samples of plants from the Ie Jue MGSA area were collected, namely Blumea balsamifera L. (DC)., Tephrosia noctiflora Baker, Ocimum americanum L., and Ziziphus rufula Miq. Plant samples were macerated with 96% ethanol and analyzed for the compounds contained in the ethanol extract using Gas-Chromatography Mass-Spectrometry (GC-MS). Compounds resulting from GC-MS that have the potential to be drug candidates were tested by Lipinski's Rule of Five (Ro5), then the docking process was carried out using Autodock Vina in the PyRx emulator software and the results were visualized using BIOVIA Discovery Visualizer 2021. The results of the molecular docking analysis showed that the compounds were lupenone, stigmasterol, lupeol, and cholesta-22,24-dien-5-ol, 4,4-dimethyl- have binding affinity values that are close to and lower towards the target receptor compared to the positive control. Based on this, it can be concluded that active compounds from plants in the Ie Jue MGSA area have therapeutic potential against SARS-CoV-2 proteins and pro-inflammatory cytokines. Keywords: MGSA Ie Jue, SARS-CoV-2, Molecular Docking
AKTIVITAS SENYAWA TUMBUHAN KAWASAN GEOTERMAL IE BRôUK TERHADAP PROTEIN SARS-COV-2 MENGGUNAKAN PENDEKATAN IN SILICO (Annisa Musdalifah, 2024)
ANALISIS POTENSI SENYAWA EKSTRAK ETANOL TUMBUHAN KAWASAN IE BRôK TERHADAP PROTEIN DAN ENZIM SARS-COV-2 SECARA IN SILICO (Fiki Farah Nabila, 2024)
SKRINING KANDIDAT IMUNOTERAPI TUMBUHAN KAWASAN MANIFESTASI GEOTERMAL SEULAWAH AGAM IE-SEU’UM TERHADAP POTENSI INFEKSI SARS-COV-2: STUDI IN SILICO (Nur Balqis Maulydia, 2022)
ANALISIS TOKSISITAS DAN POTENSI SENYAWA AKTIF SEBAGAI KANDIDAT ANTIVIRUS SARS-COV-2 SECARA IN SILICO DARI TUMBUHAN KAWASAN GEOTERMAL GUNUNG KEMBAR (GK5), GAYO LUES (CUT NUR HILDA, 2025)
ANALISIS TOKSISITAS DAN POTENSI SENYAWA AKTIF SEBAGAI KANDIDAT ANTIVIRUS SARS-COV-2 SECARA IN SILICO TUMBUHAN KAWASAN GEOTERMAL SIMPANG BALEK KABUPATEN BENER MERIAH (AUFA SABRINA THAHAR, 2025)