EKSPLORASI GEN PKS BAKTERI SIMBION SPONS LAUT ASAL PERAIRAN SABANG | ELECTRONIC THESES AND DISSERTATION

Electronic Theses and Dissertation

Universitas Syiah Kuala

    THESES

EKSPLORASI GEN PKS BAKTERI SIMBION SPONS LAUT ASAL PERAIRAN SABANG


Pengarang

Sukmawan Fajar S - Personal Name;

Dosen Pembimbing

Febriani - 197202171999032001 - Dosen Pembimbing I



Nomor Pokok Mahasiswa

1808203010005

Fakultas & Prodi

Fakultas MIPA / Kimia (S2) / PDDIKTI : 47101

Subject
Penerbit

Banda Aceh : Fakultas MIPA Magister Kimia., 2023

Bahasa

Indonesia

No Classification

593.4

Literature Searching Service

Hard copy atau foto copy dari buku ini dapat diberikan dengan syarat ketentuan berlaku, jika berminat, silahkan hubungi via telegram (Chat Services LSS)

Spons telah lama dimanfaatkan sebagai salah satu sumber dalam mengisolasi metabolit sekunder. Senyawa alam tersebut merupakan produk biosintesis bakteri simbion dari berbagai filum yang mengkolonisasi bagian jaringan spons. Beberapa bakteri simbion diketahui dapat memproduksi senyawa antibakteri akibat dari adanya kompetisi dalam mengkolonisasi jaringan dan memperoleh nutrisi dari inangnya. Salah satu contoh senyawa alam yang dihasilkan oleh bakteri simbion adalah poliketida. Produksi senyawa poliketida melibatkan enzim poliketida sintase (PKS). Keberadaan enzim PKS dapat diketahui dengan mendeteksi gen panyandi yang terdapat pada genom bakteri. Secara umum, penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi potensi biosintetik dari tujuh isolat bakteri simbion spons asal perairan Sabang dengan mendeteksi keberadaan domain gen yang ikut terlibat dalam produksi senyawa poliketida. Selain itu, pengujian aktivitas antibakteri juga dilakukan menggunakan bakteri uji Eschericia coli ATCC 25922 dan Staphylococcus aureus ATCC 25923. Isolat bakteri simbion spons tidak menunjukkan aktivitas dalam menghambat pertumbuhan E. coli maupun S. aureus. Lebih lanjut, identifikasi secara molekuler menunjukkan bahwa isolat bakteri simbion spons merupakan bakteri yang berasal dari filum firmicutes dan Actinobacteria, dimana lima dari tujuh isolat bakteri simbion spons terdeteksi mengandung gen PKS, hal tersebut mengindikasikan bahwa isolat bakteri simbion spons asal perairan Sabang memiliki potensi biosintetik dalam menghasilkan senyawa poliketida.

Kata Kunci : Spons laut, bakteri simbion, Actinobacteria, 16S rRNA, gen poliketida sintase (PKS).

Sponges have long been known as a source for isolating secondary metabolites. These natural compounds are biosynthetic products of symbiont bacteria from various phyla that colonize the sponge tissue. Some symbiont bacteria are known to produce antibacterial compounds as a result of competition in colonizing and obtaining nutrients from their hosts. One example of a natural compound produced by symbiotic bacteria is Polyketide. The production of polyketide compounds involves the enzyme polyketide synthase (PKS). The presence of the PKS enzyme can be detected by detecting the encoding gene found in the bacterial genome. In general, this study aims to explore the biosynthetic potential of seven isolates of sponge symbiont bacteria by detecting the presence of gene domain involved in the production of polyketide compounds. In addition, antibacterial activity testing was also carried out using E. coli ATCC 25922 and S. aureus ATCC 25923. Sponge symbiont bacteria were not show activity in inhibiting the growth of both testing bacteria. Furthermore, molecular identification showed that the isolates were belong to the phylum Firmicutes and Actinobacteria, where five of the seven isolates of sponge symbiont bacteria were detected to contain the PKS gene domain. The result indicated that the sponge symbiont bacteria collected from Weh Island had biosynthetic potential in producing polyketide compounds. Keywords : Marine Sponge, symbion bacteria, Actinobacteria, 16S rRNA, PKS gene domain.

Citation



    SERVICES DESK